Въпреки че теоретичната термодинамика на взаимодействията антиген-антитела е добре известна, практическото им използване при откриване или определяне на автоантитела е ограничено. За функционалните антитела определянето на оптималния афинитет позволява постигане на максимална терапевтична полза. Афинитетът на антителата се изучава почти половин век и от началото на афинитетната хроматография преди три десетилетия той се е превърнал в мощен инструмент. Affinity описва взаимодействието в отделен свързващ сайт. Познаването на афинитета, както и свойствата на конструкцията и антигена е от съществено значение за оценка на връзката между афинитета и силата на функционалното антитяло. Въпреки това, в допълнение към афинитета, има още една концепция за свързване, наречена авидност, която е общата сила на свързване на взаимодействието между многовалентния антиген и многовалентното антитяло. Въпреки очевидните различия между двете, термините афинитет и склонност често се използват безразборно. Нека да разгледаме двете.
Афинитетът е силата на свързване на паратопа на една молекула на антитела със съответния епитоп върху молекулата на антигена. Той описва взаимодействието в отделен свързващ сайт. Познаването на афинитета, както и свойствата на конструкцията и антигена е от съществено значение за оценка на връзката между афинитета и силата на функционалното антитяло. Тя се основава на същите термодинамични принципи, които управляват всяко обратимо биомолекулярно взаимодействие, същата сила на свързване, която дава възможност на имунната ви система да се пребори с инфекциите. А силата се отнася до силата на специфична връзка между антитяло и неговия антиген. Прецизната и точна оценка на афинитета за взаимодействие антиген-антитяло е важно измерване за установяване на границите на афинитет и тавана на потенция за терапевтично антитяло. В термодинамично отношение афинитетът се изразява като сумиране на всички атрактивни сили, което води до повишена сила на свързване и отблъскващи сили, което води до намалена сила на свързване.
Avidity е още едно обвързващо понятие, което често се бърка с афинитета; всъщност и двата термина се отнасят до понятието сила на свързване, с изключение на авидност се отнася до общата сила на антиген-свързващия капацитет на сместа от поликлонални антитела. Авидността се появява, когато мултивалентният антиген се свързва с двувалентно антитяло в разтвор или когато антитялото се свързва с две моновалентни молекули антиген на повърхност. За разлика от афинитета, авидността описва многовалентното свързване между множество свързващи места на лиганда и лигата съответно. Казано по-просто, авидността е свързващата сила между многовалентно антитяло и многовалентен антиген. Авидността не може да бъде описана с термодинамични термини и се получава чрез кинетични измервания. Авидността на антитялото зависи от афинитетите на отделните места за свързване на антитяло, но е по-голяма от афинитета на свързване, тъй като всички взаимодействия антитяло-антиген трябва да бъдат разрушени едновременно, за да се дисоциира антитялото.
Понятията афинитет и авидност понякога са неподходящо използвани като синоними. Всъщност и двата термина се отнасят до концепцията за сила на свързване. Афинитетът се дефинира термодинамично като измерване на степента на свързване между антитяло и антиген, докато общата сила, свързваща многовалентно антитяло към мултивалентния антиген, се нарича авидност или по друг начин известна като „функционален афинитет“. Афинитетът е силата на свързване на антитяло, комбиниращо място към един съответен антигенен епитоп, докато авидността е общата сила на антиген-свързващия капацитет на сместа от поликлонални антитела. Avidity се нарича също функционален афинитет.
Терминът афинитет обозначава константата на присъщата връзка между антитялото и едновалентния лиганд като хаптен, докато терминът авидност се използва за обозначаване на общата енергия на свързване между антитела и многовалентния антиген. Константата на асоцииране е мярка за афинитета на антитялото към епитопа. Авидността не може да бъде описана с термодинамични термини и се получава чрез кинетични измервания. В термодинамично отношение афинитетът се изразява като сумиране на енергията от близко разположени междумолекулни привлекателни и отблъскващи сили между антигенния детерминант и неговото свързващо място.
Афинитетът на антителата може да играе критична роля за определяне на биологичната активност на антителата. Така че, е необходимо да може да се характеризира отговор на антитела по отношение на афинитет, както и по величина, както и да се разбере как афинитетът на антителата може да повлияе на определен анализ. Терминът avidity понякога се използва синоним на афинитет, но най-често се използва за описание на способността на антителата да образуват стабилни комплекси с антиген. Avidity е натрупаната сила на множество афинитети на отделните свързващи антитела места.
Въпреки различията си, понятията афинитет и склонност често се използват безразборно. Афинитетът е силата на свързване на паратопа на една молекула на антитела със съответния епитоп върху молекулата на антигена и може да бъде определена само с един моновалентен фрагмент на Fab. Това е сумирането на всички атрактивни сили, което води до повишена якост на свързване и отблъскващи сили, което води до намалена сила на свързване. Авидността, от друга страна, е свързващата сила между многовалентно антитяло и многовалентна антиген и също се нарича функционален афинитет. Измерената енергия на свързване между антитела и съответните им антигени отразява авидността на антителата. За разлика от афинитета, авидността не може да бъде описана чрез термодинамични термини и се получава чрез кинетични измервания.