Думата Protoplasm произлиза от гръцката дума „protos“, което означава първо и „плазма“, което означава „образувани неща“. Протоплазмата се счита за физическата основа на живота. Протоплазмата на клетката се състои от ядро, клетъчна мембрана и цитоплазма. По този начин цитоплазмата е част от протоплазмата на клетката. Цитоплазма не се различава от протоплазмата, но е част от нея. Цитоплазма и протоплазма са клетъчни суспензии и осигуряват място, така че да протичат биологични процеси. Протоплазмата е свързана от плазмена мембрана или клетъчна мембрана от всички страни, докато цитоплазмата е веществото, което присъства около ядрото в клетката.
Цитоплазмата се състои от цитозол, органели и включвания, докато протоплазмата се състои от цитоплазма, ядро и клетъчна мембрана. Цитозолът на цитоплазмата се състои от вода, соли и органични молекули. Органелите са мъничките органичноподобни структури, присъстващи в клетката с предварително зададени и специфични функции. Включенията са неразтворими частици, присъстващи в цитоплазмата.
Протоплазмата се счита за живото вещество вътре в клетката. Това е сложно, полупрозрачно вещество, което е полутечно по консистенция и се състои главно от нуклеинови киселини, протеини, липиди, въглехидрати и неорганични соли.
Основната разлика между цитоплазма и протоплазма е, че цитоплазмата няма ядро, докато протоплазма има ядро, са нейната структура. Цитоплазма е органела на протоплазмата, която се състои главно от вода и други вещества като протеини, хранителни резерви и метаболитни отпадъци.
Протоплазмата е вискозно, вискозно вещество с желеподобна консистенция, където протичат много биологични и химични клетъчни процеси. В организмите, които имат присъствие на ядро, протоплазмата около ядрото се нарича цитоплазма. Цялото съдържание на клетката се разглежда в цитоплазмата в прокариоти (организми, лишени от ядро), докато в еукариотните организми клетъчното съдържание, присъстващо в ядрото, се диференцира от цитоплазмата чрез определена ядрена мембрана. Съдържанието в ядрото се нарича нуклеоплазма.
Неорганичните вещества, съставляващи протоплазмата, са главно вода, минерални соли и газове.
Органелите, присъстващи в цитоплазмата, са тялото на голги, митохондриите, ендоплазменият ретикулум и рибозомите. Тези органели имат много специфични и различни функции. Митохондриите имат функция на клетъчно дишане, докато рибозомите действат като места на синтеза на протеини. Други важни функции, възникващи в цитоплазмата, са гликолизата и процесите на клетъчното делене. Протоплазмата също се счита за жива част от клетката, тъй като всички важни процеси, необходими за живота на клетката, протичат в протоплазмата. За протоплазма се казва също, че придава форма на организма, тъй като е полупрозрачно, вискозно и воднисто вещество. Живата протоплазма реагира на стимули и също се отървава от отделителните продукти.
Разликата между протоплазма и цитоплазма е много малка. Протоплазма е съдържанието на клетката, включително клетъчната мембрана, цитоплазма и клетъчното ядро, докато цитоплазмата е желеобразно вещество, обграждащо ядрото в клетъчната мембрана. Цитоплазмата съдържа клетъчните органели като митохондрии, рибозоми и др. В прокариотите, където няма добре дефинирано ядро, цитоплазмата също действа като нуклеоплазма и съдържа хроматин.