Разлика между 1D и 2D гел електрофореза

Най- ключова разлика между 1D и 2D гел електрофореза са свойствата, използвани за разделяне на протеини при гел електрофореза. 1D гел електрофорезата разделя само протеини на базата на молекулното тегло, докато 2D гел електрофорезата разделя протеините въз основа на нейната електрическа точка и молекулно тегло.

Разделянето на протеини чрез гел електрофореза е важна техника за характеризиране на протеините. Протеините имат различни свойства; следователно, разделянето е по-сложно в сравнение с разделянето на ДНК чрез електрофореза на агарозен гел.

СЪДЪРЖАНИЕ

1. Преглед и ключова разлика
2. Какво е 1D гел електрофореза
3. Какво е 2D гел електрофореза
4. Прилики между 1D и 2D гел електрофореза
5. Паралелно сравнение - 1D срещу 2D гел електрофореза в таблична форма
6. Резюме

Какво е 1D гел електрофореза?

1D гел електрофореза, известна още като едноизмерна гел електрофореза, е метод за разделяне на протеини, базиран на молекулното тегло. Разделянето на протеини се извършва главно чрез електрофореза на полиакриламиден гел. Въз основа на концепцията за гел електрофореза, молекулите се разделят по свойството си на молекулно тегло и заряд.

Следователно, за да се даде равномерен заряд на протеините, лечението с натриев додецил сулфат (SDS) се извършва преди гелфофорезата. SDS денатурира протеините и осигурява равномерен отрицателен заряд на протеина; когато се прилага прилагането на електрическото поле, протеините мигрират към положителния терминал въз основа на молекулното им тегло. Така при раздяла се разглежда само едно свойство. Ето защо този метод се нарича 1D гел електрофореза.

Фигура 01: 1D гел електрофореза

По време на 1D гел електрофореза протеините се разделят въз основа на молекулното им тегло. В тази връзка молекулите с по-ниско тегло мигрират по-бързо в гела в сравнение с протеините с високо молекулно тегло. По този начин протеините с високо тегло остават близо до ямките.

Какво е 2D гел електрофореза?

2D гел електрофореза или двуизмерна гел електрофореза разделя протеините въз основа на две свойства. Двете свойства са изоелектрическата точка на протеина и молекулното тегло. Този метод на разделяне на протеин увеличава разделителната способност на разделянето на протеини. Изоелектрическата точка на протеина зависи от рН, при което протеинът е неутрален.

Фигура 02: 2D гел електрофореза

По този начин, при 2D гел електрофореза, протеинът се оставя да се движи с фиксиран градиент на pH в първото измерение. Във второто измерение протеините се разделят с помощта на вертикална или хоризонтална полиакриламидна гел електрофореза. По този начин, протеините се разделят според молекулното си тегло във второто измерение.

Освен това, този метод на гел електрофореза увеличава разделителната способност на отделяне на протеини. Следователно отделените протеини са по-чисти. Цената на техниката обаче е много по-висока от едноизмерна гел електрофореза.

Какви са приликите между 1D и 2D гел електрофореза?

• И двете техники отделят протеини.
• Следователно те са важни за характеризирането на протеините.

Каква е разликата между 1D и 2D гел електрофореза?

Ключовата разлика между 1D и 2D гел електрофорезата е, че 1D гел електрофорезата разделя протеини въз основа само на молекулното тегло, докато 2D гел електрофорезата разделя протеини на базата на изоелектрична точка и молекулно тегло. Поради тази основна разлика между 1D и 2D гел електрофореза, разделителната способност на разделянето на протеините и цената на двете техники също варира. 2D гел електрофорезата показва висока разделителна способност от 1D гел електрофорезата. 2D гел електрофорезата обаче е по-скъпа от 1D гел електрофорезата.

По-долу инфографиката обобщава разликата между 1D и 2D гел електрофореза.

Обобщение - 1D срещу 2D гел електрофореза

Разделянето на протеините разчита на много фактори. 1D гел електрофорезата разделя протеините въз основа само на молекулното тегло. Двуизмерната или 2D гел електрофореза обаче увеличава разделителната способност на отделянето на протеини. Освен това 2D гел електрофорезата разделя протеините на базата на изоелектрическата точка и молекулното тегло. Следователно тези данни са важни за преработката на протеини надолу по веригата и в областта на протеомиката. По този начин това е обобщението на разликата между 1D и 2D гел електрофореза.

справка:

1. Галева, Надежда и Михаил Алтерман. „Сравнение на едномерна и двуизмерна гел електрофореза като средство за разделяне за протеомичен анализ на микрозомите на черния дроб на плъх: цитохроми Р450 и други мембранни протеини.“ Протеомика, Национална медицинска библиотека на САЩ, юни 2002 г., налична тук.

С любезност на изображенията:

1. "Електрофореза - пълнене на 1D гел кладенци със смес от протеини" от Jean-Etienne Poirrier - пълнене на 1D гел ямки със смес от протеини (CC BY-SA 2.0) през Commons Wikimedia
2. „2D електрофореза“ от Националния здравен институт - Програма за нанобиология на Центъра за изследване на рака, Национален институт по здравеопазване (Public Domain) чрез Commons Wikimedia