Агарозата и полиакриламидът са и водоразтворими полимери, но между тях могат да се видят много разлики, като се започне от техния произход. И агарозата, и полиакриламидът имат нещо общо в способността си да образуват порести гел-матрици. Въпреки това съществуват редица различни разлики между двете. Основните разлики между двата полимера се състоят в естеството им на произход, химическата структура, различните им приложения и ефективността им по отношение на гел електрофорезата.
Агароза е естествено срещащ се линеен полимер, който от своя страна се получава от сложен полимер, наречен агар, открит в морските водорасли. Агарозата се извлича от агар чрез отстраняване на протеиновия му компонент, наречен агаропектин. Агарозата е това, което дава на агар способността му да образува гелове.
Основната употреба на агарозата е в микробиологични и молекулярно биологични изследвания. При микробиологични изследвания агарозата, когато се допълва с подходящи хранителни вещества, осигурява солидна основа за култивиране на микроорганизми като бактерии и гъбички. Когато се използва в полутвърди концентрации, може да бъде полезно при оценката на подвижността на тези микроорганизми. В молекулярната биология той служи като важен инструмент за един от най-фундаменталните процеси на разделяне, наречен „гел електрофореза' или 'електрофореза с агарозен гел'(ВЪЗРАСТ). Гел електрофорезата е процес, който позволява разделяне или разделяне на нуклеинови киселини или протеин въз основа на техния размер и заряд. Тук агарозата служи като порест гел, подобен на сито, чрез който се случва разделянето.
Структура на агароза
Полиакриламидът е синтетичен полимер и се използва в най-различни индустрии. Както беше споменато по-горе, използването му разчита на способността му да образува гелове. В допълнение към това, способността му да задържа и оттича вода в различни концентрации се използва и в различни индустрии.
Най-разпространеният и честата употреба на полиакриламид е при пречистване на отпадъчни води. Тук той се използва като флокулиращ агент за отстраняване на всеки суспендиран органичен материал; следователно, подобряване на мътността и избистряне на водата. Друга употреба на полиакриламид е в хартиената промишленост. Тук се използва за задържане или изтичане на вода от хартиената маса, както се изисква. По подобен начин в селското стопанство и строителството се използва като почвен балсам за предотвратяване на ерозия на почвата и подобряване на нейното качество.
Подобно на агарозата, и полиакриламидът се използва в молекулярната биология като важен инструмент за разделяне в подобен процес, наречен „Електрофореза на полиакриламиден гел (PAGE). В допълнение към всичко това, полиакриламидът се използва и при преработката на руда и производството на флокулиращ агент за отстраняване на всякакви суспендирани органични материали; следователно, подобряване на мътността и избистряне на водата. Друга употреба на полиакриламид е в хартиената промишленост. Тук се използва за задържане или изтичане на вода от хартиената маса, както се изисква. По подобен начин в селското стопанство и строителството се използва като почвен балсам за предотвратяване на ерозия на почвата и подобряване на нейното качество. В допълнение към всичко това, полиакриламидът се използва и при производството на хранителни добавки, меки контактни лещи и текстил.
Полиакриламидна структура
АГАРОЗНА: Агарозата е полимер с естествен произход. Той се добива от морски водорасли.
Полиакриамидни: Полиакриламидът е от синтетичен произход и не се открива при никакви естествени обстоятелства.
АГАРОЗНА: Молекулната формула на агарозата е С24Н38О19.
Полиакриамидни: Молекулната формула на полиакриламида е (С 3Н5НЕ)н.
АГАРОЗНА: Агарозата е линеен полизахарид. Той е съставен от повтарящи се дизахаридни единици, наречени агробиоза, държани заедно от водородни връзки.
Полиакриамидни: Полиакриламидът е химически омрежен полимер. Съставен е от акриламидни мономери и омрежаващо средство N, N'-метиленбисакриламид.
АГАРОЗНА: Както агарозата, така и нейната мономерна агробиоза имат нетоксичен характер.
Полиакриамидни: Мономерната единица на полиакриламид, акриламид, е предполагаем канцероген и известен невротоксин, докато полимеризираната му форма е нетоксична по своята същност.
АГАРОЗНА: Приготвянето на гел от агароза за AGE е по-малко време, лесно и просто и не изисква инициатор или полимеризиращ катализатор.
Полиакриамидни: Полиакриламидният гел за PAGE е отнемащ време и досаден и също изисква инициатор (амониев персулфат) и полимеризиращ катализатор (N, N, N ', N'-тетраметилетилетилендиамин - TEMED).
Полиакриламидните гелове са химически по-стабилни от агарозните гелове.
Предвид същата концентрация, матриците на полиакриламидния гел имат тенденция да имат по-малки пори в сравнение с матрицата на агарозен гел.
Размерът на порите на полиакриламидните гелове може да бъде променен по-контролиран начин от този на агарозните гелове.
Полиакриламидните гелове имат висока разделителна сила, докато агарозните гелове имат ниска разделителна мощност.
Полиакриламидните гелове могат да приемат по-големи количества нуклеинова киселина от агарозните гелове за разделителна способност.
С любезност на изображенията: Агароза и структура на полиакриламид чрез Wikicommons (Public Domain)