Разлика между Хромозом ходене и скачане

Ключова разлика - ходене с хромозома срещу скокове
 

Хромозомното ходене и скачането на хромозоми са два технически инструмента, използвани в молекулярната биология за локализиране на гени върху хромозомите и физическото картографиране на геномите. Хромозомното ходене е техника, използвана за клониране на прицелен ген в геномна библиотека чрез многократно изолиране и клониране на съседни клонове на геномната библиотека. Хромозомното скачане е специална версия на хромозомното ходене, която преодолява точките на пречупване на хромозомното ходене. Хромозомното ходене може само да последователно и да картографира малки дължини на хромозомите, докато хромозомното скачане дава възможност за секвениране на големи части от хромозоми. Това е ключовата разлика между хромозомното ходене и хромозомните скокове.

СЪДЪРЖАНИЕ
1. Преглед и ключова разлика
2. Какво е хромозомно ходене
3. Какво е хромозомен скок
4. Паралелно сравнение - Хромозом ходене срещу скокове
5. Резюме

Какво е хромозомно ходене?

Хромозомното ходене е инструмент, който изследва непознатите секвенции на хромозомите, като използва припокриващи се рестрикционни фрагменти. При ходене с хромозома част от известен ген се използва като сонда и продължава с характеризиране на цялата дължина на хромозомата, която трябва да бъде картографирана или секвенцирана. Това преминава от маркера до целевата дължина. При хромозомно ходене краищата на всеки припокриващи се фрагменти се използват за хибридизация за идентифициране на следващата последователност.

Сондите се приготвят от крайните парчета от клонирана ДНК и те са субклонирани. Тогава те се използват за намиране на следващия припокриващ се фрагмент. Всички тези припокриващи се последователности се използват за конструиране на генетична карта на хромозомата и намиране на целевите гени. Това е метод за анализ на дълги участъци от ДНК чрез малки припокриващи се фрагменти от възстановената геномна библиотека.

Техника за ходене с хромозоми - стъпки

1. Изолиране на ДНК фрагмент, който съдържа известния ген или маркер в близост до целевия ген

2. Изготвяне на рестрикционната карта на избрания фрагмент и субклониране на крайната област на фрагмента, която да се използва като сонда
3. Хибридизация на сондата със следващия припокриващ се фрагмент
4. Изготвяне на рестрикционната карта на фрагмент 1 и субклониране на крайния участък на фрагмента 1 за използване като сонда за идентифициране на следващия припокриващ се фрагмент.
5. Хибридизация на сондата със следващия припокриващ се фрагмент 2

6. Изготвяне на рестрикционната карта на фрагмент 2 и субклониране на крайната област на фрагмента 2, която да служи като сонда за идентифициране на следващия припокриващ се фрагмент

Горните стъпки трябва да продължат до целевия ген или до 3 'края на общата дължина на секвенцията.

Фигура 01: Техника на ходене с хромозоми

Хромозомното ходене е важен аспект на цитогенетиката при намирането на SNPs на много организми и анализирането на генетично предаваните заболявания и намирането на мутации на съответните гени.

Какво е хромозомен скок?

Хромозомните скокове са техника, използвана в молекулярната биология за физическо картографиране на геномите на организмите. Тази техника е въведена за преодоляване на бариера на хромозомното ходене, възникнала при намирането на повтарящите се ДНК участъци по време на процеса на клониране. Следователно техниката на скачане с хромозоми може да се счита за специална версия на хромозомното ходене. Това е бърз метод в сравнение с хромозомното ходене и позволява заобикаляне на повтарящите се ДНК последователности, които не са склонни да бъдат клонирани по време на хромозомно ходене. Хромозомните скокове стесняват пропастта между целевия ген и наличните известни маркери за картографиране на генома.

Хромозомният инструмент за скачане започва с изрязването на специфична ДНК със специални рестрикционни ендонуклеази и лигиране на фрагментите в циркулирани бримки. Тогава грунд, проектиран от известна последователност, се използва за последователност на циркулираните бримки. Този грунд позволява скачане и секвениране по алтернативен начин. Следователно, той може да заобиколи повтарящите се последователности на ДНК и бързо да премине през хромозомата за търсене на целевия ген.

Откриването на генните кодове за заболяване от муковисцидоза е извършено с помощта на хромозомния инструмент за скачане. Комбинирани заедно, хромозомните скокове и ходенето могат да подобрят процеса на картографиране на генома.

Фигура 02: Хромозомен скок

Каква е разликата между Хромозомното ходене и Скоковете?

Хромозом ходене срещу скокове
Хромозомата е инструмент, използван в молекулярната биология за картографиране на генома и локализиране на специфични гени.	Хромозомните скокове са инструмент, използван за физическо картографиране на геноми и бързо намиране на целеви гени в хромозомите.
Сравнителни дължини на секвениране
Чрез хромозомно ходене могат да бъдат клонирани само малки фрагменти.	По-големите дължини на хромозомите могат да бъдат картографирани чрез хромозомно скачане.
Клониране на повтаряща се ДНК в хромозоми
Техниката на ходене с хромозома има затруднения при ходене през повтарящите се ДНК последователности, открити в хромозомите.	Той позволява заобикалянето на повтарящите се последователности на ДНК. Следователно няма затруднения при намирането им по време на последователността.
Фактори, влияещи върху процесите
Успехът на процеса зависи от размера на генома и разстоянието, което трябва да бъде изминато от известна геномна позиция към желания ген.	Успехът не зависи от размера на генома на разстоянието от маркера до целта.
Ефекти от неклонирана ДНК
Хромозомното ходене може да бъде спряно от неклонирани фрагменти от ДНК.	Пиколото с най-ниска нота, което може да играе, е D4.
Нужда от известна последователност
Процесът започва с познат ген в близост до целта.	Процесът изисква известен фрагмент за проектиране на грунд.

Обобщение - Хромозомно ходене срещу скокове

Хромозомното ходене често се прилага, когато е известно, че определен ген се намира близо до предварително клониран ген в хромозома и е възможно да се идентифицира с многократно изолиране на съседни геномни клонове от геномната библиотека. Когато обаче се откриват повтарящи се ДНК участъци по време на техниката на хромозомно ходене, процесът не може да бъде продължен. Следователно техниката се пречупва от тази точка. Хромозомните скокове са молекулярно биологичен инструмент, който преодолява това ограничение за картографиране на геномите. Той заобикаля тези повтарящи се ДНК региони, които са трудни за клониране и помага при физическото картографиране на геномите. Това е основната разлика между ходенето с хромозоми и скачането.

Препратки:
1. Накасеко, Юкинобу, Ясухиса Адачи, Шин-ичи Фунахаши, Осами Нива и Мицухиро Янагида. „Хромозомното ходене показва силно хомоложна повтаряща се последователност, присъстваща във всички центромерни области на делящите се дрожди.“ Сп. EMBO. Национална медицинска библиотека на САЩ, май 1986 г. Web. 22 март 2017 г.
2. Тахери, Али. "Хромозом ходене и скачане." Напредък в генното инженерство. OMICS International, 30 октомври 2013. Web. 22 март 2017 г.