Разлика между Cosmid и Phagemid

Най- ключова разлика между Cosmid и Phagemid е от типа последователности, които съдържа. Cosmid съдържа cos сайт и плазмид. Следователно, той е хибриден вектор, докато Phagemid е плазмид, който съдържа F1 произход на репликация на F1 фага.

Cosmids и Phagemids се използват за клониране, особено за клониране на по-големи фрагменти от ДНК. Те са широко използвани особено при клониране на гени, отговорни за производството на различни протеини. Космидите и фагемидите се реплицират самостоятелно като плазмиди или се пакетират във вирусни частици и след това се реплицират.

СЪДЪРЖАНИЕ

1. Преглед и ключова разлика
2. Какво е Космод
3. Какво е фагемид
4. Прилики между Космид и Фагемид
5. Паралелно сравнение - Cosmid срещу Phagemid в таблична форма
6. Резюме

Какво е Космод?

Cosmid, обозначаван като хибриден плазмид, съдържа cos места, извлечени от ламбда-фагови частици и плазмид. Тези cos сайтове са дълги фрагменти от ДНК с 200 базови двойки. Следователно те имат сплотени или лепкави краища, които позволяват на плазмида да се побере във вирусната ДНК. Следователно, cos сайтовете са жизненоважни за опаковане на ДНК.

Има три cos сайта;

• cosN сайт - участва в никирането на нишката на ДНК чрез активност на терминаза
• cosB сайт - ангажиран с държане на терминазата.
• cosQ сайт - участва в предотвратяването на разграждането на ДНК от DNases.

Фигура 01: Космид

Също така, Cosmids могат да репликират едноверижна ДНК или двуверижна ДНК, използвайки подходящ произход на репликация. Космидите обикновено съдържат гени за антибиотична резистентност като маркери за селекция на трансформанти. По този начин, използването на космод като вектор може да улесни клонирането и след това рестрикционният ензим усвояване на вектора може да извлече тези фрагменти.

Какво е фагемид (плазмид)?

Фагемид, наричан също като плазмид, също е тип хибриден вектор. Phagemid съдържа специален произход на репликация, наречен като f1 произход на репликация. F1 произход на репликация извлича от f1 фаг.

Phagemid може да възпроизведе едноверижна и двуверижна ДНК. Репликацията може или да се проведе като плазмид, докато е подложена на независима репликация, или може да се опакова във фагови частици и накрая да зарази бактериален гостоприемник Е коли. При заразяване на Е коли клетки, f1 фагът изисква наличието на стълб. Следователно, секс пили са важни по време на инвитро опаковане на Phagemids.

Какви са приликите между Cosmid и Phagemid?

• Както Cosmid, така и Phagemid са клониращи вектори, използвани в рекомбинантната ДНК технология.
• Cosmid и Phagemid могат да репликират едноверижна и двуверижна ДНК.
• И двете могат да претърпят независима репликация, подобна на плазмидите.
• Cosmid и Phagemid могат да се подложат инвитро опаковане и заразяване на бактериални клетки.
• Както Cosmid, така и Phagemid изискват подходящ произход на репликация за клониране.

Каква е разликата между Космид и Фагемид?

Cosmid срещу Phagemid
Cosmid е хибриден вектор, който съдържа cos сайт и плазмид.	Phagemid е плазмид, който съдържа F1 произход на репликация на F1 фага.
Наличие на Cos сайтове
Cos сайтовете присъстват в космида и са необходими за ин витро опаковки.	Cos сайтовете отсъстват във фагемид.
Наличие на F1 Произход на репликация
В космида fi произходът на репликацията може да има или да не съществува.	F1 произход на репликация присъства във фагемид.
Наличие на антибиотични резистентни гени
Антибиотичните резистентни гени присъстват в космидите за идентифициране на трансформантите от нетрансформантите.	При фагемиди липсват резистентни на антибиотици гени.
Изискване на ин витро опаковката
Изисква cos сайт.	Изисква секс стълб.

резюме - Cosmid срещу Фагмидната

Cosmid и Phagemid са клониращи вектори, използвани в рекомбинантната ДНК технология. Cosmids са хибридни вектори, които съдържат специални лепкави краища, известни като cos сайтове. инвитро опаковките изискват тези cos сайтове. Докато фагемидите са плазмиди, които съдържат f1 произход на репликация, извлечен от f1 фаг. Както космоидът, така и фагемидът могат да претърпят независимо репликация или инвитро опаковане на бактериални клетки. Това са важните разлики между космида и фагемида.

справка:

1.Qi, H, et al. „Фагемидни вектори за фагов дисплей: свойства, характеристики и конструкция.“ Списание за молекулярна биология., Национална медицинска библиотека на САЩ, 30 март 2012 г. Достъпно тук 
2.Collins, J и B Hohn. „Cosmids: тип вектор за клониране на ген на плазмидите, който се опакова in vitro в главите на бактериофага на ламбда.“ Proceedings of the National Academy of Sciences на Съединените американски щати, Национална медицинска библиотека на САЩ, септември 1978 г. Достъпно тук  

С любезност на изображенията:

1.'Cosmid (на английски) 'От Zlir'a (CC0) през Wikimedia на Commons