Разлика между FISH и CGH

Най- ключова разлика между FISH и CGH е това FISH е молекулярна техника, която открива специфична последователност на ДНК на хромозома, използвайки флуоресцентно маркирани сонди, докато CGH е друга молекулярна цитогенетична техника, която открива промени в геномната ДНК.

Цитогенетичният анализ играе важна роля в медицината, когато открива хромозомни аномалии като анеуплоидии, делеции, дублирания и пренастройки и др. Хромозомните аномалии в крайна сметка водят до генетични заболявания като рак, безплодие, синдром на Даун, синдром на Клайнфелтер, синдром на Търнър, левкемия и др. . Съществуват различни молекулярни цитогенетични методи за откриване на гореспоменатите дефекти и заболявания. Сред тях FISH (флуоресцентна in situ хибридизация) и CGH (сравнителна геномна хибридизация) са две мощни техники за хибридизация. И двата метода обаче имат плюсове и минуси.

СЪДЪРЖАНИЕ

1. Преглед и ключова разлика
2. Какво е риба 
3. Какво е CGH
4. Прилики между FISH и CGH
5. Паралелно сравнение - FISH срещу CGH в таблична форма
6. Резюме

Какво е РИБА?

FISH е техника на хибридизация на нуклеинова киселина, изпълнена върху част или част от тъкан, в цялата тъкан или клетки. Това е метод на базата на сондата. Техниката зависи от теорията на допълващото базово сдвояване на Уотсън Крик, което води до или ДНК - ДНК хибриди, или ДНК - РНК хибриди, които по този начин могат да открият мутирали гени или да идентифицират гена, който представлява интерес. Освен това, тази техника използва едноверижни ДНК последователности, двуверижни ДНК последователности, едноверижни РНК секвенции или синтетичен олигонуклеотид, получени при използване на ник транслация като сонди, които са допълващи генологичните последователности от интерес. Освен това, най-важната характеристика на тази техника е етикетирането на сондите с флуоресцентни багрила. Така сондите се свързват с допълващите се части на хромозомата и улесняват откриването.

Освен това FISH е изключително чувствителен и специфичен метод. Следователно това е често срещана техника както при изследване, така и при диагностициране на хематологични злокачествени заболявания и солидни тумори. Но, FISH показва ниска разделителна способност. Той също така изисква предварителни познания за целевата аномалия за проектиране на последователности на сондата.

Фигура 01: РИБИ

Има много приложения на FISH, главно в молекулярната диагностика на инфекциозни заболявания за идентифициране на наличието на патогени и за потвърждаване на патогена чрез молекулярна диагностика. Освен това, FISH е често използвана техника в областта на биологията на развитието, кариотипирането и филогенетичния анализ и физическото картографиране на хромозомите.

Какво е CGH?

Сравнителната геномна хибридизация (CGH) е друга молекулярна цитогенетична техника на базата на ДНК, която може да открие промените на геномните ДНК последователности. Методът е усъвършенстван метод, който може да анализира хромозома и генни модификации, за да открие промените или измененията в геномните ДНК последователности. Освен това, CGH изисква изолиране и фрагментиране на ДНК от експерименталната проба и референтната проба. След това пробите трябва да бъдат етикетирани с помощта на две различни флуоресцентни багрила (обикновено червени и зелени). По-късно и двете проби се смесват и се допускат до конкурентна хибридизация. Последната стъпка е анализът на пробите за промени в ДНК, като дублиране на гени, загуба на ген и др. По-специално, той измерва разликите в броя на копията на ДНК между тестовата проба и контролната проба.

Фигура 02: CGH

Друга версия на CGH е налична сега; това е по-напреднал метод от нормалната CGH. Това е техника, наречена CGH базирана на масив или aCGH. aCGH позволява точното идентифициране на делеции на ген или последователност в много хиляди последователности в един единствен експеримент.

Какви са приликите между FISH и CGH?

• FISH и CGH са две молекулярни техники.
• И FISH, и CGH разчитат на хибридизация на нуклеинова киселина.
• Също така и двете техники се нуждаят от проектирани сонди за откриване на специфични ДНК цели.
• Използваме ги за пренатална и постнатална диагностика на генетични заболявания.
• Освен това, FISH и CGH са много мощни инструменти за изследване на геномните промени.
• Те използват флуоресцентни багрила за етикетиране на сондите.

Каква е разликата между FISH и CGH?

FISH е an на място хибридизационна процедура, която използва флуоресцентни сонди за откриване на специфични последователности на ДНК, докато CGH е техника на молекулярна хибридизация, която открива промените на геномните ДНК последователности. И така, това е ключовата разлика между FISH и CGH.

Нещо повече, FISH изисква предварително познаване на целевата аномалия за проектиране на сонда последователности, докато CGH не изисква предварителни познания. Освен това, допълнителна разлика между FISH и CGH е, че FISH показва ограничена разделителна способност, докато aCGH показва висока разделителна способност.

По-долу инфографиката обобщава разликата между FISH и CGH.

Обобщение - FISH срещу CGH

FISH и CGH са две молекулярни цитогенетични техники, които улесняват откриването на генетични последователности от интерес. FISH улеснява откриването на специфична последователност на ДНК на хромозома, използвайки флуоресцентно маркирани сонди, докато CGH улеснява откриването на промени в геномната ДНК. И така, това е ключовата разлика между FISH и CGH.

справка:

1. „Флуоресценция в хибридизацията на ситу (FISH)“ Nature News, Nature Publishing Group, достъпна тук.
2. Хестер, Сюзън Д и др. „Сравнение на технологии за сравнителна геномна хибридизация във всички Microarray платформи.“ Списание за биомолекулярни техники: JBT, Асоциацията на съоръженията за биомолекулярни ресурси, април 2009 г., достъпно тук.

С любезност на изображенията:

1. „Multiplex ViewRNA FISH анализ в Jurkat и HeLa клетки” от Райън Джефс - Собствена работа (CC BY-SA 3.0) през Commons Wikimedia
2. „Схема на CGH“ от Mbaudis (беседа) (Качи) - Собствена работа (CC BY 2.5) през Commons Wikimedia