Разлика между геномната ДНК и изолацията на плазмидната ДНК

Най- ключова разлика между геномната ДНК и плазмидната ДНК изолация е, че геномната ДНК изолация е насочена към извличането на геномна ДНК, докато плазмидната ДНК изолация е насочена към извличането на плазмидна ДНК на бактериите.

ДНК изолацията е химичен процес, използван за изолиране на ДНК от различни видове или от различни проби. Изолацията на ДНК е важна в техниките за молекулярна биология надолу по веригата, като гел електрофореза, верижна реакция на полимераза и техники за секвениране на ДНК. Следователно изолирането на ДНК е съществен химичен процес в молекулярно биологичните изследвания. Въз основа на целта на изследването понякога е необходимо да се изолира геномната ДНК. В допълнение, някои изследвания се фокусират върху изолирането на плазмидната ДНК от бактериите. Изолирането на геномната ДНК е процесът на изолиране на геномната ДНК от прокариотна или еукариотна проба. Етапите на изолация се различават в зависимост от вида на клетката, в която се изолира ДНК. Изолирането на плазмидната ДНК е процесът на изолиране на плазмидна ДНК от бактериална клетка. В сравнение с геномната ДНК изолация, цялостният процес е сложен при плазмидна ДНК изолация.

СЪДЪРЖАНИЕ

1. Преглед и ключова разлика
2. Какво е геномната ДНК изолация
3. Какво е изолация на плазмидна ДНК
4. Прилики между геномната ДНК и изолацията на плазмидната ДНК
5. Сравнение рамо до рамо - Изолация на геномна ДНК срещу плазмидна ДНК в таблична форма
6. Резюме

Какво представлява геномната ДНК изолация?

Изолирането на геномната ДНК е процесът на извличане на цялата геномна ДНК на организма. Този конкретен процес включва три основни събития. Те са, клетъчен лизис или ядрен лизис, разграждане на протеини или протеолиза и утаяване на геномната ДНК. Етапът на лизис може да се различава в зависимост от типа на клетката. При прокариотите, тъй като има пептидогликанова клетъчна стена, първата стъпка трябва да бъде разрушаването на клетъчната стена. От друга страна, при еукариотите, етапът на лизис включва разрушаване на плазмената мембрана и ядрената мембрана за извеждане на ДНК към екстериора. За разлика от тях, специални стъпки са от съществено значение за лизирането на стените на растенията и гъбичките.

Фигура 01: Изолация на геномна ДНК

Следователно, след като стъпката на лизис приключи, в крайна сметка ДНК ще стигне до супернатанта. Едновременно с това се извършва разграждане на протеини в разтвора поради добавянето на протеиназа K. Следващата стъпка е да се отделят геномната ДНК и разградените протеини една от друга. Следователно, разградените протеини се отделят чрез утаяване, което позволява на геномната ДНК да остане в супернатантата. След утаяване на протеините, геномната ДНК може да бъде утаена и повторно суспендирана в подходящ буфер, докато това не се изисква за експеримента.

Геномната ДНК, която е линейна ДНК, съдържа цялата генетична информация на организма. С други думи, геномът е материал на наследствеността на жив организъм, който е отговорен за всички структурни и функционални дейности на клетката. Състои се както от кодиращи, така и от некодиращи ДНК последователности. При изолиране на геномната ДНК тя включва целия геном на организма.

Какво представлява изолацията на плазмидна ДНК?

Изолацията на плазмидната ДНК е специален и по-сложен процес на изолиране на ДНК. Плазмидите са екстрахромозомна ДНК, присъстваща в повечето бактериални клетки. Те са спяща кръгова ДНК, която поддържа бактериите да оцелеят в тежки условия на околната среда. Плазмидната ДНК се състои от специални резистентни гени, които осигуряват допълнителни предимства на бактериите като антибиотична резистентност, свойства на вирулентност и токсични свойства.

Фигура 02: Изолация на плазмидна ДНК

Изолацията на плазмидната ДНК включва също три основни процеса; клетъчен лизис, протеинолиза и утаяване на ДНК. Въпреки че биохимичният механизъм на изолиране е подобен на този на геномната ДНК изолация, процесът е по-сложен от него. Процесът на лизис на клетките е най-важният процес в тази процедура. Най-важното е, че геномната ДНК и плазмидната ДНК не трябва да се смесват помежду си. Следователно много по-лек процес на лизис се включва в процедурата за изолиране на плазмидната ДНК. Следователно, в повечето процедури за изолиране на плазмидна ДНК се използва детергентът; натриев додецил сулфат за клетъчния лизис.

Какви са приликите между геномната ДНК и изолацията на плазмидната ДНК?

• Изолацията на геномната ДНК и плазмидната ДНК се фокусира върху извличането на ДНК на организма.
• Освен това и двамата следват един и същ общ процес, който включва лизис на клетките, разграждане на протеини и утаяване на ДНК.
• Освен това, получената ДНК и на двата процеса е важна за процесите надолу по веригата.
• Нещо повече, и двата процеса на изолиране включват етапите за пречистване и съхраняване на ДНК при определени условия на съхранение.
• Освен това протеиназата К се използва и в двата метода за разграждане на протеините.

Каква е разликата между геномната ДНК и изолацията на плазмидната ДНК?

Изолацията на геномната ДНК се фокусира върху извличането на цялата геномна ДНК на целевия организъм, докато плазмидната ДНК изолация се фокусира върху изолирането само на плазмидна ДНК от конкретния вид бактерии. Следователно, това е ключовата разлика между геномната ДНК и изолацията на плазмидна ДНК. Освен това, друга разлика между геномната ДНК и изолацията на плазмидна ДНК е в процедурата. Изолацията на геномната ДНК е по-малко сложна процедура в сравнение с изолацията на плазмидна ДНК. Следователно, когато изолирате плазмидната ДНК, е необходимо да се вземат предпазни мерки, за да се предотврати смесването на геномна и плазмидна ДНК помежду си.

По-долу infograohic предоставя допълнителни подробности за разликата между геномната ДНК и изолацията на плазмидна ДНК.

Обобщение - Геномна ДНК срещу Изолация на плазмидна ДНК

ДНК изолацията е важен процес в техниките на молекулярната биология. Има два типа ДНК, а именно геномна ДНК и плазмидна ДНК (екстра-хромозомна ДНК). Въз основа на изискването някои процедури се извършват за изолиране на геномна ДНК, докато някои процедури се фокусират върху изолиране само на плазмидна ДНК от бактерии. Следователно стъпките, участващи в двата процеса, се различават леко една от друга. Въпреки това, цялостният процес е един и същ и в двете изолации. Изолираната ДНК и на двата процеса има огромна употреба при процеси надолу по веригата като клониране, гел електрофореза и полимеразна верижна реакция. В края на протокола за изолиране на геномната ДНК, цялата геномна ДНК на организма може да бъде изолирана като краен продукт, докато в края на протокола за изолиране на плазмидната ДНК плазмидната ДНК на съответната бактерия може да бъде изолирана като краен продукт. Следователно, това е разликата между геномната ДНК и изолацията на плазмидна ДНК.

справка:

1. "ДНК ЕКСТРАКЦИЯ ОТ БАКТЕРИЯ." ДНК извличане от бактерии. Налични тук 

С любезност на изображенията:

1. "Извличане на ДНК" от Джо Нат - Собствена работа, (CC BY-SA 4.0) през Wikimedia на Commons 
2. „Плазмид минипреп” от Retama - Собствена работа, (CC BY-SA 4.0) през Wikimedia на Commons