Разлика между мотив и домейн

Най- ключова разлика между мотив и домейн е, че мотивът не е независимо стабилен, докато домейнът е независимо стабилен.

Протеините са важни биологични макромолекули, присъстващи в нашето тяло. От друга страна, генетичният код на ген ще определи аминокиселинната последователност на протеин. Освен това протеините имат първични, вторични и третични структури. Първичната структура е аминокиселинната последователност на полипептидната верига. Когато полипептидните вериги се сгънат една с друга, тя образува вторичната структура на протеина. Алфа-спиралите, бета листовете и супер-вторичните структури принадлежат към вторичните структури. Някои групи от свръх-вторични елементи са известни като протеинови мотиви. Третичната структура на един протеин се отнася до неговата триизмерна структура, която определя функцията на протеина. Домейнът е сгънат участък от протеинова молекула, която е кълбовидна и има дискретна функция. Това е основната функционална и триизмерна структура на протеина.

СЪДЪРЖАНИЕ

1. Преглед и ключова разлика
2. Какво е мотив
3. Какво е домейн
4. Прилики между мотив и домейн
5. Паралелно сравнение - Мотив срещу Домен в таблична форма
6. Резюме

Какво е мотив?

Мотивът е определено групиране на супер вторичните елементи на протеини като алфа спирали и бета структури. Те са някакъв вид модели, присъстващи в различни протеини. Мотивите описват моделите на сгъване на вторичните структурни елементи и техните взаимодействия. Тези модели на сгъване се стабилизират чрез подобни връзки, които присъстват в третичните структури. Те обаче не са толкова сложни, колкото третичните структури.

Фигура 01: Мотив

Те са прости комбинации от вторични структури на протеини. Мотивът не е стабилен сам по себе си. Освен това мотивите обясняват структурата на протеин, но не предвиждат функцията на протеин. Примери за протеинови мотиви са бета-алфа-бета мотив, гръцки ключов мотив, бета барел, бета-меандър мотив и т.н..

Какво е домейн?

Домейнът е основна, функционална и триизмерна единица на протеин. Той изпълнява определена функция. Един единствен протеин може да има няколко различни домена. Всеки домейн е независима единица. Това е кълбовидна структура. Той е отговорен за конкретна функция или взаимодействие. Домените могат да се използват за хипотезиране на функцията на нехарактеризиран протеин. Когато анализирате протеин, е важно да се вземе предвид, тъй като домените са функционалните единици на протеина.

Фигура 02: Три различни домена на пируват киназа

Домените са много стабилни и компактни структури. Те могат лесно да бъдат разграничени от други региони. Пируват киназата има три различни домена, както е показано на фигура 02. Дължината на домена може да варира и средната дължина е 100 аминокиселини. Всеки домейн съдържа хидрофобно ядро, изградено от вторични структурни единици. Няколко домена заедно изграждат третичната структура на протеин.

Какви са приликите между мотив и домейн?

• Мотивът и домейнът са единици, присъстващи в самите протеинови молекули.
• Те са полезни при класифицирането на белтъчни семейства.

Каква е разликата между мотив и домейн?

Мотивът е определено групиране на супер вторичните елементи на протеини като алфа хелици и бета структури, докато домейнът е функционалната единица на протеин. Освен това, мотивът е вторична структура, докато домейнът е отговорен за третичната структура на протеина. Освен това, домейнът е независима единица, за разлика от мотив. Също така, домейнът изобразява функцията на протеин, докато мотивът не е. Това са основните разлики между мотив и домейн. По-долу инфографиката представя разликата между мотив и домейн в таблична форма.

Обобщение - Мотив срещу домейн

Мотивът е подредба на вторични структури на протеиновата молекула. Той обикновено не е стабилен сам по себе си, за разлика от домейн. Домейнът е независимо стабилна структура на протеин. Следователно, тя може да бъде част или цяла протеинова молекула. Това е триизмерна фундаментална функционална единица на протеина. Освен това тя има функция и е независима единица. Мотивът може да бъде част от домейна. Но домейнът не може да бъде част от мотив. Това е разликата между мотив и домейн.

справка:

1. „Домен протеин.“ Уикипедия, Фондация Уикимедия, 31 юли 2018 г. Достъпно тук

С любезност на изображенията:

1. "Ключов мотив за протеин от антракс токсин" От NatelewisDerivative work (CC BY-SA 3.0) чрез Commons Wikimedia
2. "Пируват киназа протеинови домейни" от Thomas Splettstoesser - Собствена работа, (CC BY-SA 3.0) през Commons Wikimedia