Разлика между протеомиката и метаболомиката

Най- ключова разлика между протеомиката и метаболомиката е това протеомиката е изследване на всички протеини в организма, докато метаболомиката е изследване на всички метаболити на организма.

Геномиката е изследване на генетичния състав на организма. Протеомиката и метаболомиката са две омически науки, свързани с геномиката. Протеома се отнася до всички протеини в клетка или организъм. От друга страна, метаболомът се отнася до всички метаболити на организма. Така изследването на протеома е протеомиката, докато изследването на метаболома е метаболомиката. И протеомиката, и метаболомиката са важни в диагностиката на заболяванията, както и в характеризирането и скрининга на организмите. Освен това и двете са свързани в много аспекти на клетъчната биология, особено в клетъчната сигнализация, разграждането на протеините и генерирането и посттранслационната модификация.

СЪДЪРЖАНИЕ

1. Преглед и ключова разлика
2. Какво е протеомика
3. Какво е метаболомия
4. Прилики между протеомиката и метаболомиката
5. Паралелно сравнение - Протеомика срещу метаболомия в таблична форма
6. Резюме

Какво е Протеомика?

Протеома е общото протеиново допълнение в клетка, тъкан или организъм. Следователно протеомиката е изследване на протеома на един организъм. В протеомиката се анализират различни характеристики на протеините. Следователно протеомиката се фокусира основно върху структурата, ориентацията, функциите, протеиновите взаимодействия, модификациите, приложенията и значението на протеините. Ето защо в момента се провеждат много изследователски проекти в областта на протеомиката.

Първите протеомични проучвания са направени за идентифициране на съдържанието на протеини в Escherichia coli. Картирането на общото съдържание на протеини беше направено с помощта на двумерни (2D) гелове. След успеха на този проект учените преминават към характеризиране на общото съдържание на протеини в животни като морски свинчета и мишки. В момента картографирането на протеини при човека се извършва с помощта на 2D гел електрофореза.

Има много предимства при изучаването на протеомиката, тъй като протеините са управляващи молекули с най-голяма активност поради свойството на катализатора на протеините. По този начин, изследването на цели протеини може да предостави информация относно здравословното състояние на организма. Освен това, протеомиката има много приложения в анотацията на генома, идентифицирането на болестта и диагностиката, провеждането на изследвания за експресия на протеини по време на експерименти и модификации на протеини и проучвания за взаимодействие и др.

Фигура 01: Протеомика

Съществуват различни техники, участващи в протеомиката, включително екстракция на общия протеин, разделяне на тях с помощта на 2D гел електрофореза, секвениране на екстрахираните протеини с помощта на методи като метод на секвениране на Едмънд или масспектрометрия и анализ на структурни и функционални свойства на протеина с използване компютърно базиран софтуер и инструменти за биоинформатика.

Какво е метаболомиката?

Метаболомиката е изследване на всички метаболити в клетка, тъкан или организъм. Тя включва идентифицирането и количественото определяне на клетъчните метаболити с помощта на различни съвременни аналитични и статистически инструменти. Метаболомиката е важно проучване, тъй като разкрива информация относно метаболизма на организма.

Фигура 02: Метаболомия

За да изучава субстрати и продукти на метаболитни реакции, метаболомиката използва масова спектрометрия като аналитична платформа. Масспектрометрията води до метаболити и техните концентрации, отразяващи действителното биохимично състояние на клетките или тъканите. Следователно метаболомиката може да се счита за най-доброто представяне на молекулярния фенотип на организма. В допълнение към тях метаболомите могат да се разглеждат като продължение на протеомиците, тъй като повечето метаболити се генерират поради дейността на ензими, които са протеини.

Какви са приликите между протеомиката и метаболомиката?

• Протеомиката и метаболомиката са две омически науки, свързани с геномиката.
• Метаболомиката може да се разглежда като продължение на протеомиката.
• Протеомите и метаболомите са тясно преплетени с много изследвания.

Каква е разликата между протеомиката и метаболомиката?

Протеомиката е мащабното изследване на протеини, включително тяхната структура и функция, в рамките на клетка или организъм. Междувременно метаболомиката е изследване на метаболитните профили в клетка, тъкан или организъм при даден набор от условия. И така, това е ключовата разлика между протеомиката и метаболомиката. Освен това, протеомиците засягат главно пълния набор от протеини, докато метаболомичните главно засягат пълния набор от метаболити, включително разнообразен набор от малки молекули като пептиди, въглехидрати, липиди, нуклеозиди и катаболни продукти на екзогенни съединения и т.н. Ето защо това е друга разлика между протеомиката и метаболомиката.

По-долу инфографиката обобщава разликата между протеомиката и метаболомиката.

Обобщение - Протеомика срещу метаболомика

Живите организми могат да бъдат изследвани с помощта на техния геном, протеини и метаболити. Геномиката, протеомиката и метаболомиката са трите области, които изучават съответно генетичния състав, протеините и метаболитите на клетка или организъм. Протеомиката е важна, тъй като е динамично отражение както на гените, така и на околната среда. Метаболомиката е много важна, тъй като директно отразява текущото състояние на биохимичната реакция на клетките или метаболитния статус на организма. По този начин, това обобщава разликата между протеомиката и метаболомиката.

справка:

1. П, Сурат. „Как са свързани метаболома и протеомите?“ Новини, 26 февруари 2019 г., достъпни тук.
2. Хорган, Ричард П и Луиз C Кени. „Технологии за преглед на SAC„ Omic “: геномика, транскриптомика, протеомика и метаболомия.“ Акушерство и гинекология, John Wiley & Sons, Ltd (10.1111), 18 юли 2011 г., Достъпно тук.

С любезност на изображенията:

1. „Протеомика“ от Xxl7441 от английски Wikibooks - Прехвърлен от en.wikibooks в Commons. (Public Domain) чрез Wikimedia на Commons
2. „Метаболомична схема“ От Lmaps (беседа) - Създадох изцяло тази работа сам (CC BY-SA 3.0) чрез Commons Wikimedia