Най- ключова разлика между VNTR и сондата е това VNTR е кратка нуклеотидна последователност, възникваща като тандем повторение в генома, докато сондата е изкуствено синтезирана къса последователност от ДНК или РНК, която може да бъде радиоактивно белязана.
VNTR означава повторение на тандем с променлив номер. Това е кратка нуклеотидна последователност, организирана в тандем повторения в генома. VNTR се срещат естествено в нашия геном. Сонда е изкуствено синтезирана къса ДНК или РНК последователност. И сондата, и VNTR са нуклеинови киселини или къси нуклеотидни последователности. Те имат огромна употреба в различни молекулярни биологични техники, главно в криминалистични изследвания. VNTR и сонда споделят някои прилики, както и разлики. Следователно статията се опитва да подчертае разликата между VNTR и сондата.
1. Преглед и ключова разлика
2. Какво е VNTR
3. Какво е сонда
4. Прилики между VNTR и сонда
5. Паралелно сравнение - VNTR срещу сонда в таблична форма
6. Резюме
VNTR е кратка нуклеотидна последователност, която съществува като повторение в тандем в нашия геном. VNTRs присъстват в много хромозоми. Освен това, VNTR се различават при различните индивиди от дължините, тъй като броят на повторенията е различен при VNTR на различни хора. По принцип се дължи на алели, наследени от техните родители. Затова използваме главно VNTR за родителски идентификации (наследяване) или за лични цели. По подобен начин е възможно да се използват и в генетиката, криминалистиката, биологичните изследвания и отпечатването на ДНК. Следователно VNTR е важен инструмент в молекулярната биология.
Фигура 01: VNTR
В наследяването анализираме VNTR данни, използвайки два основни принципа: съвпадение на наследство и съвпадение на идентичност. По време на съвпадение по наследство, индивидът трябва да има алел за съвпадение с този на всеки родител. По време на съвпадение на идентичност и двата алела на VNTR трябва да присъстват на определено място на генома.
В контекста на молекулярната биология, сонда е изкуствено синтезиран фрагмент от ДНК или РНК с дължина от 100 до 1000 бази. Можем радиоактивно да маркираме тези сонди. Следователно, ние ги използваме за откриване на прицелни нуклеотидни последователности, които са допълващи последователността на сондата. Когато добавим сонди към пробата, се извършва хибридизация с допълващите последователности или целеви последователности и ни улеснява при идентифицирането на целевите последователности. Тъй като сондите носят радиоактивност, можем да ги открием лесно.
Фигура 02: Сонда
В криминалистиката обикновено използваме сонди в техники за профилиране на ДНК като откриване на къси участъци в повторен тандем, полиморфизми с дължина на рестрикционния фрагмент и отпечатване на ДНК.
VNTR е регион на генома, организиран като повторение в тандем, докато сондата е къса ДНК или РНК последователност, синтезирана изкуствено, за да се открият целеви последователности в пробата. И така, това е ключовата разлика между VNTR и сондата. Също така важна разлика между VNTR и сондата е, че за разлика от VNTR, ние можем радиоактивно да маркираме сондите.
Освен това VNTRs най-вече извършват родителска идентификация, докато сондите помагат за откриване на прицелни нуклеотидни последователности в ДНК или РНК проби, които са комплементарни на последователността на сондата. Следователно това също е съществена разлика между VNTR и сондата.
Следващата инфографика представя повече информация за разликата между VNTR и сондата.
Общата употреба на VNTR и сонда е в техники за молекулен анализ, като криминалистични изследвания и ДНК-отпечатъци. И двете се състоят от променливи дължини. Ключовата разлика между VNTR и сондата е, че VNTR е област на генома, подредена с повторения в тандем, докато сондата е фрагмент от ДНК или РНК, които биха могли да бъдат белязани радиоактивно. Освен това VNTRs присъстват в генома. Но, сондите са изкуствено синтезирани и могат да бъдат белязани радиоактивно, за да открият целеви нуклеотидни последователности в ДНК или РНК проби, които са комплементарни на последователността в сондата. По този начин това е обобщението на разликата между VNTR и сондата.
1. „Променлив брой повторения на тандема (VNTR) и приложението му в бактериалната епидемиология.“ Science Alert: Journal, достъпен тук.
2. "ДНК сонда." Nature News, Nature Publishing Group, достъпна тук.
1. “D1S80Demo” от PaleWhaleGail в английската Уикипедия (CC BY-SA 3.0) през Commons Wikimedia
2. „Молекулярни маяци“ (CC BY-SA 3.0) през Wikimedia на Commons