Разлика между VNTR и STR

Ключова разлика - VNTR срещу STR
 

ДНК изследванията имат огромна полза при разбирането и определянето на филогенетични връзки, диагностицирането на генетични заболявания и картографирането на геномите на организма. Няколко техники, свързани с ДНК анализ, се използват за идентифициране на определен ген или ДНК последователност в пул с неизвестна ДНК. Те са известни като генетични маркери. Генетичните маркери се използват в молекулярната биология за идентифициране на генетични вариации между индивиди и видове. Променливо число повторение на тандем (VNTR) и кратко повторение на тандем (STR) са два вида генетични маркери, които показват полиморфизъм сред индивидите. И двата типа са некодиращи повтарящи се ДНК, които са в тандем повторения. Те са подредени в хромозоми от главата до опашката. VNTR е участък от генома, където късата нуклеотидна последователност се повтаря няколко пъти. STR е друга секция на ДНК в генома, която е организирана като повтарящи се единици, състоящи се от два до тринадесет нуклеотида за сто пъти. Ключовата разлика между VNTR и STR е броят на нуклеотидите в повтаряща се последователност. Повтарящите се единици на VNTR се състоят от 10 до 100 нуклеотиди, докато повтарящата се единица на STR се състои от 2 до 13 нуклеотида. VNTR и STR се използват широко в криминалистични изследвания.

СЪДЪРЖАНИЕ

1. Преглед и ключова разлика
2. Какво е VNTR 
3. Какво е STR
4. Прилики между VNTR и STR
5. Паралелно сравнение - VNTR срещу STR в таблична форма
6. Резюме

Какво е VNTR?

Повторението в тандем е кратка последователност от ДНК, която се повтаря от главата до опашката при специфичен хромозомен локус. Няма друга последователност или нуклеотид в рамките на повторението на тандема. В генома има няколко вида повторения на тандема. VNTR е вид повторение в тандем сред тях, което има повтарящи се единици, състоящи се от 10 до 100 нуклеотида. VNTR е вид минисателит. Тези повторения в тандем могат да бъдат открити в много хромозоми. Те са взаимосвързани в човешкия геном и са разположени предимно в субтеломерните области на хромозомите.

 VNTR показват тандем повтарящ се полиморфизъм сред индивидите. Дължината на VNTR в определено място на хромозомата е силно променлива сред индивидите поради разликата в броя на повтарящите се единици, организирани в тази ДНК секция. Следователно VNTR може да се използва като мощен инструмент за идентифициране на индивиди и VNTR анализът се използва в много области, включително генетика, биологични изследвания, криминалистика и печат на ДНК. VNTR бяха първите генетични маркери, използвани за количествено определяне на костномозъчния трансплантант. VNTR бяха и първите полиморфни маркери, използвани при профилиране на ДНК в криминалистиката.

Фигура 01: Вариация на VNTRs при шест индивида

VNTR анализът се извършва чрез полиморфизъм с дължина на рестрикционен фрагмент, последван от южна хибридизация. Следователно, тя се нуждае от сравнително голяма ДНК проба. Интерпретацията на VNTR профил също е проблематична. Поради тези ограничения, използването на VNTR в криминалистичната генетика е ограничено и той е заменен от STR анализ.

Какво е STR?

STR е силно повтаряща се ДНК секция, която се състои от две до тринадесет нуклеотидни повтарящи се единици, организирани в тандем. STR е подобен на VNTR. Но тя варира от VNTR от броя на нуклеотидите в повтаряща се последователност и броя на повторенията. STR е вид микросателит.

STR анализ, включващ измерване на точния брой повтарящи се единици. STRS са силно променливи сред индивидите, подобно на VNT. STR профилите се различават от човек на човек. Следователно, STR анализът се използва в молекулярната биология за сравняване на специфични локуси върху ДНК от две или повече проби. Следователно СТР се считат за мощни генетични маркери в молекулярната биология. Той осигурява отличен инструмент за идентификация на индивидите поради високата им степен на полиморфизъм и сравнително къса дължина.

Понастоящем СТР са най-често използваният анализиран генетичен полиморфизъм в криминалистичната генетика. Повечето криминалистични дела включват полиморфен анализ на СТ. STR локусите са разпространени в целия геном. Има хиляди СТР, разположени в хромозоми, които могат да бъдат използвани в съдебномедицински анализ. STR анализът не включва полиморфизъм с рестрикционна дължина като VNTR анализ. STR анализът не реже ДНК с рестрикционни ензими. Използват се специфични сонди за прикрепване на желаните участъци върху ДНК и с помощта на PCR техниката се определят дължините на STR.

Фигура 02: вариация на STR между пробите

Какви са приликите между VNTR и STR?

• VNTR и STR са некодираща ДНК.
• И двете са повторения в тандем.
• И двамата показват полиморфизъм сред индивидите поради разликата в дължината на секцията на ДНК.
• И двете се използват като мощни генетични маркери при отпечатване на пръсти с ДНК и в криминалистични изследвания.

Каква е разликата между VNTR и STR?

VNTR срещу STR
VNTR е некодираща повтаряща се ДНК, която има кратка нуклеотидна последователност, повторена в тандем.	STR е силно повтаряща се ДНК секция, която се състои от две до тринадесет нуклеотидни повтарящи се единици, организирани в тандем.
размер
VNTR са по-големи от STR.	STR-ите са по-малки от VNTR.
Брой нуклеотиди в повтаряща се последователност
Повтарящата се единица на VNTR се състои от 10 до 100 нуклеотида.	Повтарящата се единица на STR се състои от 2 до 13 нуклеотида.

Обобщение - VNTR срещу STR

VNTR и STR са два мощни генетични маркера, използвани в молекулярната биология, особено в областта на съдебната генетика. VNTR е тип минисателит, а STR е микросателит. VNTR и STR са некодираща, много повтаряща се ДНК. Те са тандем повторения. Общата структура на VNTR и STR са еднакви. Броят на нуклеотидите в повтарящата се последователност и дължината са различни. VNTR има повтарящи се последователности, състоящи се от 10 до 100 нуклеотида. STR има повтарящи се последователности, състоящи се от 2 до 13 нуклеотида. Това е разликата между VNTR и STR.

Изтеглете PDF версия на VNTR срещу STR

Можете да изтеглите PDF версия на тази статия и да я използвате за офлайн цели, съгласно цитираните бележки. Моля, изтеглете PDF версия тук Разлика между VNTR и STR.

Препратки:

1. „Науката за съдебната генетика.“ CRG - Съвет за отговорна генетика. N.p., n.d. Web. Налични тук 10 юли 2017г.
2. „STR анализ“. Wikipedia. Фондация Уикимедия, 22 март 2017. Уеб. Налични тук 10 юли 2017г.

С любезност на изображенията:

1. “D1S80Demo” от PaleWhaleGail в английската Уикипедия (CC BY-SA 3.0) през Commons Wikimedia