Разлика между клонирането чрез клониране и секвоирането на пушка

Най- ключова разлика между клонирането чрез клониране на секвенция и секвенцирането на пушка се крие в техния метод на поведение. Методът на клониране чрез клониране на клониране включва картографиране на хромозоми и клониране преди секвениране, докато клонирането чрез секвенциониране на пушка пропуска както хромозомното картографиране, така и стъпките на клониране по време на секвенирането.

Клониране чрез клониране на клониране и клониране чрез изстрелване на пушка са два метода на модерно секвениране на генома. Клонирането чрез клониране на клониране е по-надежден метод за секвениране. Методът на клониране чрез секциониране на пушка обаче е по-бърз и по-евтин. Статията се фокусира върху фината разлика между клонирането чрез клониране на секвенция и секвенцирането на пушка.

СЪДЪРЖАНИЕ

1. Преглед и ключова разлика
2. Какво е клониране чрез клониране на секвениране 
3. Какво е клониране чрез секциониране на пушка
4. Прилики между клонирането чрез клониране и секвоирането на пушка
5. Паралелно сравнение - Клониране чрез клониране на секвенция срещу секцио на секции в таблична форма
6. Резюме

Какво е клониране чрез клониране на секвениране?

Клониране чрез клониране на клониране е метод на секвенция на геноми. Тя изисква картографиране на всяка хромозома преди разделянето на ДНК. След картографирането ДНК трябва да се разгради на фрагменти с дължина 150 килобази. След това тези фрагменти са готови за секвениране. Следваща стъпка е вкарването на ДНК фрагменти в бактериални изкуствени хромозоми (BACs) и след това в бактериални клетки. Тъй като фрагментите вече са вътре в бактериалните клетки, всеки път, когато бактериите се разделят, вмъкнатите ДНК фрагменти също се разделят и създават много идентични копия. След това, отделната бактериална ДНК-клон се раздробява на 500 базови двойки дълги фрагменти. Те са по-малки и припокриващи се фрагменти. На следващо място, секвенирането се осъществява с вмъкването на тези фрагменти във вектор с известна ДНК последователност. Изхождайки от известната последователност на вектора, секвенирането продължава до неизвестна последователност.

След приключване на секвенирането е необходимо да се идентифицират областите на припокриващи се последователности. След това съединяването на фрагментите става, за да се образуват по-големите фрагменти, първоначално представени в BACs. След това сглобяването на по-големи фрагменти в хромозомата се извършва в съответствие с картата на генома.

Фигура 01: Клониране чрез клониране

Значителното предимство на клонирането чрез клониране на клониране е, че предварително подготвената карта на генома помага за надеждно сглобяване на по-големи фрагменти. Но недостатъкът на този метод на секвениране е, че отнема много време генерирането на карти на генома и създаването на клонове. Това обаче беше методът, предпочитан по време на „Проекта за човешкия геном“.

Какво е клониране чрез секциониране на пушка?

Клонирането чрез секвениране на пушка е метод за секвениране, който произволно разгражда последователностите на ДНК на много малки фрагменти и преобразува последователността, като наблюдава припокриващи се региони. По-големите геноми на бозайници са трудни за клониране на последователност и сглобяване. Това се дължи на тяхната структурна сложност и размер. Въпреки че клонът чрез метода на секвениране на клони е надежден, отнема много време за секвениране на геноми на сложни организми. Следователно клонирането чрез секвениране на пушка се е превърнало в надежден по-евтин метод на секвениране, който може да се извърши по-бързо. Следователно, съвременните учени разчитат на този метод на последователност за справяне със сложни геноми.

Фигура 02: Клониране чрез секциониране на пушка

По време на клонирането по метода на секвенциране на пушка, не се извършват конвенционални карти за геномиране и стъпки за клониране. Първоначално целият геном е фрагментиран на различни размери от 20 килобази до 300 килобази. След това се извършва последователност. След това, използвайки сложен компютърен софтуер, е необходимо да се съберат фрагментите, като се разгледат припокриващите се региони.

Клонирането чрез изстрелване на пушка помага да се подобри точността на съществуващите последователности на генома. Основното предимство на този метод е, че той е много по-бърз и по-евтин от клонирането чрез метода на клониране на клониране. Този процес обаче не включва използването на генетична карта. Следователно, по-вероятно е да възникнат грешки по време на сглобяването. По този начин, това е основен недостатък при клонирането чрез метод на секвенция на пушка.

Какви са приликите между клонирането чрез клониране и секвоирането на пушка?

• И клонирането чрез клониране, и секвенцирането на пушка са два метода на секвенция на генома.
• По време на двете техники на секвениране се извършва сглобяване на разбити фрагменти чрез идентифициране на припокрити участъци.
• Също така, разбиването на ДНК на по-малки фрагменти е необходимо както за клониране, така и за последователност на пушка.

Каква е разликата между клонирането чрез клониране и секвоиране на пушка?

Клонирането чрез техника на секвениране на клони включва два основни етапа: картографиране на хромозоми и клониране. За разлика от тях, клонирането чрез секвенциране на пушка не следва тези две стъпки; тя случайно разгражда последователностите на ДНК на много малки фрагменти и отново сглобява последователността, като наблюдава припокриващи се региони. Следователно, това е ключовата разлика между клонирането чрез клониране и секвенциране на пушка. Поради този фактор, клонирането чрез клониране на клониране е скъп и отнемащ време процес, докато клонирането чрез секциониране на пушка е по-бързо и по-евтино.

Въпреки това грешките по време на сглобяването са по-малко вероятни да възникнат по време на клониране чрез клониране на секвениране. Следователно, той има висока надеждност. Обаче клонирането чрез секвениране на пушка е сравнително по-малко надеждна техника. Така че това също е съществена разлика между клонирането чрез клониране на секвенция и секвенцирането на пушка.

По-долу информационната графика представя повече информация относно разликата между клониране чрез клониране и секвенция на пушка.

Обобщение - Клониране чрез клониране на секвенция срещу стрелба

Обобщавайки разликата между клониране чрез клониране и секвенция на пушка, клонирането чрез клониране на секвенция и секвенцирането на пушка са два метода на секвенция на генома. Обаче клонирането чрез техника на секвениране на клони включва както процеси на картографиране на генома, така и процеси на клониране, докато клонирането чрез секвенциране на пушка не го прави. И така, това е ключовата разлика между клонирането чрез клониране на секвенция и секвенцирането на пушка. Тъй като картографирането на генома се извършва по време на клониране чрез клониране на последователности, по-малко вероятно е да възникнат грешки по време на сглобяването на секвенции. Но клонирането чрез секциониране на пушки е много по-бърз и по-евтин процес. И все пак, той е сравнително по-малко надежден. Клонирането чрез клониране на секвениране беше предпочитаният метод за секвениране по време на „Проекта на човешкия геном“. Но съвременният молекулен биолог разчита повече на клониране чрез секвенциониране на пушки.

справка:

1. „Какво е секвенция от клониране по клониране?“ Факти, Екипът за обществена ангажираност в кампуса на Wellcome Genome, 17 ноември 2014 г., достъпен тук.
2. "Какво е секциониране на пушка?" Факти, Екипът за обществена ангажираност в кампуса на Wellcome Genome, 17 ноември 2014 г., достъпен тук.

С любезност на изображенията:

1. „Стъпки на молекулярното клониране“ от Alexpicardal97 - Собствена работа, CC BY-SA 4.0) през Commons Wikimedia
2. „Последователност на пушка lg“ от Националния институт за изследване на човешкия геном - Национални здравни институти. Национален институт за изследване на човешкия геном. „Говорим речник на генетичните термини.“ Получено на 17 ноември 2016 г. (обществено достояние) чрез Wikimedia Commons