Разлика между Exome и Transcriptome

Ключова разлика - Exome срещу Transcriptome
 

Генът съдържа кодиращи и некодиращи региони в него. Кодиращите последователности са известни като екзони, а некодиращите последователности са известни като интрони. Нуклеотидната последователност на екзоните на ген представлява генетичния код на гена, който синтезира специфичния протеин. Следователно, екзоните остават в молекулата на мРНК. Общият регион на екзона на генома е известен като екзема и той е важна част от генома. Генетичният код на гените се преобразува в генетичния код на молекулата на мРНК, която е необходима за производството на протеин. Целите молекули на мРНК, транскрибирани в клетка или клетъчна популация в даден момент, са известни като транскриптом. Ключовата разлика между exome и transcriptome е тази exome представлява последователностите на регионите на екзона на генома докато транскриптом представлява общата иРНК на клетка или тъкан в даден момент.

СЪДЪРЖАНИЕ
1. Преглед и ключова разлика
2. Какво е Exome
3. Какво е препис
4. Паралелно сравнение - Exome срещу Transcriptome
5. Резюме

Какво е Exome?

Гените са съставени от екзони, интрони и регулаторни последователности. Екзоните са генните региони, които се транскрибират в иРНК последователност по време на транскрипцията. Интрони и други некодиращи региони се премахват по време на транскрипцията. Нуклеотидната последователност на екзоните определя генетичния код на гена, който синтезира специфичния протеин, който кодира. Само екзоните остават в тРНК на протеин. Колекцията от екзони в генома е известна като екзома на организъм. Той представлява част от генома, която се експресира в гени. При хората екзомите представляват 1% от генома. Това е протеин-кодиращата част на човешкия геном.

Фигура 01: Exome

Какво е препис?

Транскриптомът е събирането на всички кодиращи протеини и некодиращи стенограми (РНК) в дадена тъкан. Транскриптомът представлява събирането на общи молекули на мРНК, експресирани от гените в клетка или тъкан. Стенограмата на клетката може да бъде различна от транскрипта на друг тип клетки. Транскриптомът също е динамичен - той се променя с времето в отговор на вътрешни и външни стимули. Дори в една и съща тъкан или в един и същ тип клетка, транскриптома може да се промени след няколко минути.

Transcriptome се различава от exome на организъм. Транскриптомът включва само експресираните exome последователности. Въпреки че екзема на клетката остава същият, транскриптомът се различава между клетките, тъй като генната експресия не е еднаква за всички клетки или тъкани. Само различни гени се експресират в различни клетки и тъкани. Експресията на гена е специфичен за тъкан или клетъчен процес процес. Той се регулира от различни фактори, включително фактори на околната среда. Следователно, стенограмата може да варира в зависимост от условията на външната среда.

Transcriptome се използва като предшественик за проучвания на протеомиката. Всички протеини са получени от мРНК последователности. Транслационните модификации могат да доведат до промени в протеините. Въпреки това, транскриптома предоставя важна основна информация за протеомичните изследвания.

Фигура 02: Транскрипт на ембрионални стволови клетки

Каква е разликата между Exome и Transcriptome?

Exome срещу Transcriptome
Exome е събирането на протеин-кодиращ регион на гените.	Transcriptome е съвкупността от цялата транскрибирана РНК, включително иРНК.
проба
Exome се изследва с помощта на ДНК проба.	Transcriptome се изследва с помощта на РНК проба.
Метод на изследване
Последователността на цялото exome е методът за изучаване на exome.	РНК секвенирането е методът за изучаване на транскрипта.

Обобщение - Exome vs Transcriptome

Екзоните са кодиращите последователности на гените и определят mRNA последователностите на протеините. Колекцията от тези кодиращи последователности (екзони) е известна като екзома на организма. Гените се транскрибират в молекули на иРНК преди да направят протеини. Общите мРНК молекули на клетка или тъкан във всеки даден момент са известни като транскриптоми. Транскриптомът представлява гените, които се експресират активно в иРНК във всеки даден момент. Транскриптомът е специфичен за клетките и тъканите и влияе на условията на околната среда. Това е разликата между exome и transcriptome.

Препратки:
1. Сара и др., „Целенасочено улавяне и масово паралелно разделяне на дванадесет човешки дохода.“ Nature. Национална медицинска библиотека на САЩ, 10 септември 2009 г. Web. 01 април 2017г
2.Mutz et al. „Транскриптен анализ с използване на последователност от следващо поколение.“ Elsevier: Локатор на статии. N.p., септември 2012. Web. 01 април 2017г

С любезност на изображенията:
1. "Стенограмата на плюрипотентните клетки" От Grskovic, M. и Ramalho-Santos, M., The pluripotent transcriptome (10 октомври 2008 г.), StemBook, ed. Общност за изследване на стволови клетки, StemBook, doi / 10.3824 / стволник.1.24.1, http://www.stembook.org. - [1] DirectStemBook Фигура 2 Транскриптът на плюрипотентни клетки.Грскович, М. и Рамалхо-Сантос, М., Плурипотентният препис (10 октомври 2008 г.), StemBook, изд. Общност за изследване на стволови клетки, StemBook, doi / 10.3824 / стволник.1.24.1, (CC BY 3.0) през Commons Wikimedia