Разлика между GFP и EGFP

Най- ключова разлика между GFP и EGFP е, че GFP е див тип протеин, включен в молекулярното клониране на клетки без бозайници, докато EGFP е подобрен или проектиран тип GFP, който може да бъде използван върху клетки на бозайници.

Молекулярното клониране е усъвършенствана техника, която учените използват изключително много при експресиране на протеини чрез рекомбинантна технология. При рекомбинантната ДНК технология е необходимо успешно да се трансформира рекомбинантният вектор, за да бъде домакин на организма. Следователно, по време на процеса на трансформация, трябва да се идентифицира и потвърди дали гена, който представлява интерес, е трансформиран или не за гостоприемника. За да оценят това, молекулярните биолози приемат няколко техники. Един от тези техники, един е репортер ген. Тези репортерни гени действат като избираеми маркери за подбор на правилните трансформанти. По този начин, зеленият флуоресцентен протеин (GFP) и засиленият зелен флуоресцентен протеин (EGFP) са два репортерни протеина, използвани в молекулярното клониране.

СЪДЪРЖАНИЕ

1. Преглед и ключова разлика
2. Какво е GFP
3. Какво е EGFP
4. Прилики между GFP и EGFP
5. Паралелно сравнение - GFP срещу EGFP в таблична форма
6. Резюме

Какво е GFP?

GFP е протеин от див тип, който съдържа 238 аминокиселинни остатъци и няколко избираеми области на аминокиселинни последователности, които го отличават от другите флуоресцентни протеини. Освен това, този див тип протеин първоначално е бил в изолация от Aequorea Victoria; вид медуза. Въпреки това, при природни явления, медузите успяха да произведат флуоресценция на зелен цвят в отговор на определени стимули.

По-рано тази концепция изненада учените и те решиха да я използват на своите рекомбинантни ДНК технологии. Следователно учените използват тази мутантна форма на дивия тип ген като репортер ген в своите изследвания на генна експресия. Дивият тип на GFP е способен да произвежда протеин, който дава флуоресценция при стайна температура или под ултравиолетова светлина. Следователно, когато се вмъкне в трансформантите, той експресира и произвежда флуоресценция. Ако след процеса на трансформация се получи флуоресценция, това потвърждава успеха на процеса на трансформация. С прости думи, флуоресцентната емисия сигнализира за успешната трансформация на вектора, който носи гена от интерес в гостоприемника.

Фигура 01: GFP

Поради тази причина GFP действа като in vivo маркер за генна експресия. Понастоящем за производството на GFP се използват техники за генно инженерство. Също така са налични много подобрени версии на GFP, като EGFP. Следователно, това позволява ефективно използване на GFP в проучвания за молекулно клониране и генна експресия.

Какво е EGFP?

Подобреният зелен флуоресцентен протеин или EGFP е подобрена версия на GFP. С прости думи можем да определим EGFP като разработена версия на див тип GFP. Когато дивият тип ген на GFP мутира, той предизвиква благоприятни ефекти. Следователно, мутираният ген на GFP позволява експресията на нови знаци и в резултат на това можем да произведем Подобрен GFP с подобрени характеристики. Освен това, можем да въведем мутации успешно в гена от див тип GFP, използвайки облъчване или химически методи. След това тези мутирали гени произвеждат EGFP, който има по-полезни характеристики.

Фигура 02: EGFP

Подобрените характеристики на EGFP са както следва;

• Способен да излъчва по-силни флуоресцентни сигнали.
• Има висока чувствителност.
• Може да го използва върху клетки на бозайници, вместо прокариоти и други еукариоти от по-ниско ниво.
• Също така осигурява повишена чистота на продукта.

Следователно, в сравнение с GFP, EGFP е предпочитаният избор за изследвания на генната експресия. Продуктът обаче е по-скъп в сравнение с GFP.

Какви са приликите между GFP и EGFP?

• GFP и EGFP са два протеина, които имат способността да излъчват зелен цвят
• Следователно и двамата функционират като репортерни протеини в проучванията на генната експресия.
• Също така е възможно да се синтезират и двете, като се използва рекомбинантна ДНК технология.
• Освен това е лесно да се мутират допълнително тези два типа, за да се синтезират подобрени форми.

Каква е разликата между GFP и EGFP?

Репортерният ген е ген, който се свързва с гена от интерес към рекомбинантната ДНК технология. Той сигнализира за успешната трансформация на рекомбинантния вектор в гостоприемника. Тук GFP и EGFP са два вида зелени флуоресцентни протеини, които работят като репортерни протеини. Ключовата разлика между GFP и EGFP обаче е, че GFP е див тип, докато EGFP е разработена версия на GFP. Освен това EGFP има по-полезни характеристики от GFP. Например, EGFP произвежда по-силна флуоресцентна светлина и е по-чувствителен от GFP. Друга разлика между GFP и EGFP са системите, в които можем да ги използваме. Системите без бозайници използват GFP, докато бозайниковите системи използват EGFP.

Инфографиката по-долу представя разликата между GFP и EGFP в таблична форма.

Обобщение - GFP срещу EGFP

GFP и EGFP са репортерни протеини в проучвания за молекулно клониране и генна експресия. GFP е дивият тип протеин, който е зелен флуоресцентен протеин. Първоначално протеинът се изолира от медузите Aequorea victoria. За разлика от това, EFGP е подобрена форма на GFP протеин. Той е мутант от див тип с подобрени характеристики. Следователно, EFGP има по-висока сила на сигнала и по-висока чувствителност. Следователно, можем да го използваме на вектори на бозайници. За разлика от тях, използването на GFP е главно само върху вектори, които не са бозайници. Най-вече това е разликата между GFP и EGFP.

справка:

1.Cinelli, RA и др. „Подобреният зелен флуоресцентен протеин като инструмент за анализ на динамиката и локализацията на белтъците: Локално флуоресцентно проучване на едномолекулно ниво.“ Фотохимия и фотобиология., Национална медицинска библиотека в САЩ, юни 2000 г. Достъпно тук  
2. „PDB101: Молекула на месеца: Зелен флуоресцентен протеин (GFP).“ RCSB: PDB-101. Налични тук

С любезност на изображенията:

1. "Флуоресцентни протеинови филми GFP" от Ерин Род - Собствена работа, (CC BY-SA 4.0) през Commons Wikimedia 
2. ”CA2 amigo2 eGFP мишка” от Дудек, Серена; Куруана, Дъглас; Карстенс, Кели - Собствена работа (CC BY-SA 3.0) през Commons Wikimedia