Разлика между RNASE A и RNASE H

Ключова разлика - RNASE A срещу RNASE H
 

Рибонуклеазите са нуклеази, които специфично разграждат РНК на по-малки единици. Те могат да бъдат разделени на две категории; ендорибонуклеази и екзорибонуклеази. Ендорибонуклеазата е ендонуклеаза, която може да разгради едноверижна или двуверижна РНК. Той разцепва фосфодиестерните връзки в полинуклеотидната верига на РНК. Примерите са RNase A, RNase III, RNase T1, RNase P и RNase H. Екзорибонуклеазата е екзонуклеаза, която разгражда РНК чрез отстраняване на крайните нуклеотиди от 5'-края или 3'-края на молекулата на РНК. Примерите са RNase R, RNase II, RNase D и RNase PH. Най- ключова разлика между RNASE A и RNASE H е, че RNase A е панкреатична рибонуклеаза, която конкретно разгражда едноверижната РНК на по-малки компоненти, докато RNase H е неспецифичен ензим, който разцепва РНК в хибрид на РНК-ДНК на по-малки единици чрез хидролитичния механизъм.

СЪДЪРЖАНИЕ

1. Преглед и ключова разлика
2. Какво е RNASE A
3. Какво е RNASE H
4. Прилики между RNASE A и RNASE H
5. Паралелно сравнение - RNASE A срещу RNASE H в таблична форма
6. Резюме

Какво е RNASE A?

RNase A е панкреатична рибонуклеаза, която специфично разцепва остатъците от цитозин и урацил в 3 'края на едноверижната РНК. RNase H работи при по-висока концентрация на сол (0,3 М или по-висока концентрация на NaCl). Хидролитичната реакция е на два етапа. Той образува 3 'фосфорилиран продукт чрез 2', 3 'цикличен монофосфатен междинен продукт. Въпреки че е специфичен за едноверижната РНК при по-висока концентрация на сол, тя може също да разгради двуверижна РНК и РНК в хибрид на РНК-ДНК при по-ниска концентрация на NaCl (по-ниска от 0,3 М NaCl).

Брус Мерифийлд първо синтезира този ензим. RNase A е много популярен ензим в молекулярните изследвания. РНК-аза на панкреас по говедата е пример за RNase A. И това е един от най-твърдите ензими, които се използват в лабораторията. Този ензим не се нуждае от кофактор за своята активност. Това е силно термостабилен ензим. RNase A е първият ензим и третият протеин, за които е открита правилна последователност на аминокиселини. Този ензим е много малък с 124 аминокиселини и молекулна маса 12600da. И има четири остатъка от хистидин (His 12 и His 119, които участват в каталитична реакция).

Фигура 01: RNase A

RNase A може да бъде изолирана чрез варене на сурова проба. Когато заври, всички останали ензими разграждат останалата RNase A. RNase A е невероятно стабилен ензим. Този ензим инхибира с протеин инхибитора на рибонуклеаза, тежки метали и уридин ванадат комплекси.

Какво е RNase H?

RNase H е неспецифичен рибонуклеазен ензим, който може да разгради РНК в хибриден РНК-ДНК чрез хидролитична реакция. RNase H разцепва 3'-О-Р връзката на РНК в хибрид РНК-ДНК. В крайна сметка той произвежда 3'OH и 5 'фосфатно прекратени продукти. При репликацията на ДНК той играе основна роля, като отстранява РНК праймер, след като се образуват нови нишки на ДНК. В лабораторни условия тя конкретно разгражда РНК в хибриден РНК-ДНК, но не ДНК и нехибридизирана РНК. И този ензим обикновено се използва за унищожаване на матрицата на РНК, след като по време на синтеза на кДНК се образува първата допълваща ДНК верига.

Фигура 02: RNase H

RNase H също използва в тестове за защита от нуклеаза. Той може да бъде включен и за отстраняване на опашката на поли A от mRNA. RNase H има способността да унищожава некодиращата РНК вътре и извън клетката. Металните йони са необходими като кофактори за тази протеинова активност. Хелатор (EDTA) може да се използва за инхибиране на ензима RNase H.

Какви са приликите между RNASE A и RNASE H?

  • И двете са протеинови по природа.
  • И двете са ендорибонуклеаза
  • И двете могат да деградират РНК.
  • И двете извършват хидролитични реакции.
  • Молекулярните лаборатории използват и двете.

Каква е разликата между RNASE A и RNASE H?

RNASE A срещу RNASE H

RNase A е панкреатична рибонуклеаза, която специално разцепва 3 'края на неподредени цитозин и урацилови остатъци от едноверижна РНК при по-висока концентрация на сол. RNase H е неспецифичен рибонуклеазен ензим, който може да разгради РНК в хибриден РНК-ДНК чрез хидролитична реакция.
 Характер на РНК разцепване
RNase A специално разцепва едноверижна РНК при по-висока концентрация на сол. RNase Н разцепва РНК в хибрид на РНК-ДНК.
Нужда от ко-фактори за дейност
RNase A не се нуждае от кофактори за своята активност. RNase H се нуждае от метални йони като кофактори за своята активност.
 Инхибитори на протеиновата активност
Рибонуклеазният инхибиторен протеин, тежки метали и уридин ванадатни комплекси инхибира активността на РНКаза А. Хелаторът (EDTA) инхибира активността на RNase H.
Отстраняване на РНК праймер при репликация на ДНК
RNase A не се използва за отстраняване на РНК праймер при репликация на ДНК. RNase H се използва за отстраняване на РНК праймер при репликация на ДНК
Отстраняване на ДНК шаблон в допълващ синтез на ДНК (С-ДНК)
RNase A не се използва за отстраняване на РНК шаблон по време на допълващ синтез на ДНК (С-ДНК). RNase H се използва за отстраняване на РНК шаблон по време на допълващ синтез на ДНК (С-ДНК).
Отстраняване на Poly-A-Tail в иРНК хибридизирана до Oligo (dt)
RNase A не се използва за премахване на "поли-A опашка" в мРНК, хибридизирана до олиго (dt). RNase H се използва за премахване на "поли-A опашка" в мРНК, хибридизирана до олиго (dt)

резюме - RNASE A срещу RNASE H

Рибонуклеазите са нуклеазни ензими, които имат способността да разцепват РНК на по-малки единици. Те са два вида; ендорибонуклеази и екзорибонуклеази. Ендорибонуклеазата е ендонуклеаза, която има способността да разгражда едноверижна или двуверижна РНК. И разцепва фосфодиестерната връзка в полинуклеотидната верига на РНК. RNase A и RNase H са две ендорибонуклеази. RNase A е панкреатична рибонуклеаза, която специално разцепва остатъците от цитозин и урацил в 3 'края на едноверижната РНК при по-висока концентрация на сол. RNase H е неспецифичен рибонуклеазен ензим, който може да разгради РНК в хибриден РНК-ДНК чрез хидролитична реакция. Това е разликата между RNase A и RNase H.

Изтеглете PDF RNASE A срещу RNASE H

Можете да изтеглите PDF версия на тази статия и да я използвате за офлайн цели, съгласно цитираната бележка. Моля, изтеглете PDF версия тук Разлика между RNASE A и RNASE H

справка:

1.Карутури, Автор Амрута. „17 трябва да знам факти за RNase A.“ AG Blog, 22 февруари 2017. Достъпно тук
2. "рибонуклеазен". Уикипедия, Фондация Уикимедия, 5 януари 2018 г. Достъпно тук  

С любезност на изображенията:

1.'RNase A'By Не е предоставен машинно четим автор. Vossman предполага (въз основа на претенции за авторски права)., (CC BY-SA 2.5) през Wikimedia на Commons
2.'RNase H fix'Yy Не е предоставен машинно четим автор. Vossman прие (въз основа на претенции за авторски права)., (CC BY-SA 2.5) през Wikimedia на Commons