Разлика между YAC и M13 фагов вектор

Ключова разлика - YAC срещу M13 Phage Vector
 

ДНК клонирането е важен процес, който позволява размножаването на важни ДНК фрагменти на организмите. Това изисква съединяване на специфична ДНК с векторна ДНК, за да се създаде рекомбинантна ДНК, която се трансформира в организма гостоприемник. Вектор е молекула на ДНК, която се държи като средство за пренасяне на чужд генетичен материал в друга клетка или организъм. Той трябва да може да се репликира вътре в организма гостоприемник и да произвежда множество копия на рекомбинантна ДНК. Има различни видове вектори, използвани при клонирането на ДНК. Дрождната изкуствена хромозома (YAC) и фазовият вектор M13 са два вида сред тях. Ключовата разлика между YAC и фазовия вектор M13 е тази YAC е изкуствена хромозома, която се репликира в клетките с дрожди докато Фаговият вектор M13 е едноверижна кръгова ДНК на бактериофаг М13, която се репликира във E Coli клетки.

СЪДЪРЖАНИЕ
1. Преглед и ключова разлика
2. Какво е YAC
3. Какво е фазов вектор M13
4. Паралелно сравнение - YAC срещу M13 Phage Vector
5. Резюме

Какво е YAC Vector?

YAC е изкуствено изградена хромозома, която има способността да носи голям сегмент от чужда ДНК и да се възпроизвежда в клетките на дрождите. Той има центромерни, теломерни и автономно репликиращи последователности, важни за репликацията и стабилността. YAC също трябва да носи селективен маркер или маркери и рестрикционни сайтове, за да го направи ефективен клониращ вектор. Големи последователности, вариращи от 1000 kb до 2000 kb, могат да бъдат вмъкнати в YAC и прехвърлени в мая.

Фигура 01: YAC вектор

Какво е фазов вектор M13?

Бактериофаг М13 е вирус, който заразява и репликира в E Coli. Геномът на бактериофага M13 е с малки размери, около 6,7 kb. Това е едноверижна, кръгла и положителна ДНК сензор. Този вирус специално заразява E Coli бактерии чрез F пилус. След като влезе в ssDNA в бактерията, той синтезира нейната допълваща верига и става dsDNA или репликативната форма (RF) на M13. RF може да се държи като плазмид в организма гостоприемник. DsDNA репликира вътре E Coli и произвежда ssDNA, носеща нови фаги. Тези нови фаги непрекъснато се освобождават от E Coli без да убива клетката гостоприемник. Инфекцията обаче забавя растежа на E Coli. dsDNA може да бъде извлечена от бактериални клетки и използвана като вектори при клониране на ДНК. Те са известни като фазови вектори M13. Те могат лесно да се манипулират и да се използват подобно на плазмидните вектори.

Вродената способност за инфекция на тези M13 фаги служи като добра квалификация, която може да се използва като вектор при клониране на гени. Когато се развива M13 във вектор, в неговия геном трябва да бъдат включени няколко елемента. Те са ген за лак репресора (lac I) протеин, проксималния оператор на областта лак Z ген, лак промотор и множествен сайт за клониране (полилинкер). Когато dsDNA на M13 се използва като вектори, тя може да се третира като плазмиден вектор. Въпреки това, използването на ssDNA M13 има предимства в секвенирането на ДНК и мутагенезата, насочена към мястото.

Тъй като М13 фагов вектор носи множество места за клониране във Lacz региона, рекомбинираните вектори могат лесно да бъдат идентифицирани чрез скрининг на синя / бяла колония върху агарови плочи, съдържащи IPTG и X-Gal. Сините плаки, произведени върху плаките, не съдържат рекомбинираните фаги. Поради това за целта на клониране могат да бъдат избрани фаги с вложки.

Фигура 02: Бактериофаг М13

Каква е разликата между YAC и M13 Phage Vector?

YAC срещу M13 Phage Vector

YAC е генетично проектирана хромозома, която има способността да носи голям сегмент от чужда ДНК и да се репликира в клетките на дрождите.. Фаговият вектор M13 е вирусен вектор, разработен от бактериофаг М13, който се използва за вмъкване на чужда ДНК в E Coli.
Предназначение
YACs са проектирани да клонират големи фрагменти от геномна ДНК в мая. M13 фагови вектори се използват за вмъкване на чужда ДНК в E Coli.
Поставете дължина
YAC могат да съдържат генетични вложки с размер на мегабазата (1000 kb - 2000 kb). Размерът на вложките е около 1500 bps.
строителство
YAC ДНК е трудно да се пречисти непокътнат и изисква висока концентрация за генериране на YAC векторна система. То се осъществява чрез циклична фотосинтетична електронна верига.
стабилност
YAC е нестабилен. М13 фаги могат лесно да бъдат извлечени.
размер
Ензимите са по-големи молекули. М13 фаги са стабилни от YAC.

Обобщение - YAC срещу M13 Phage Vector

YAC е изкуствено изградена векторна система, използваща специфична област от дрождена хромозома за вмъкване на големи сегменти от генетичен материал в клетките на дрожди. Фаговият вектор M13 е векторна система, получена от бактериофага М 13, който използва Е коли като организъм гостоприемник. Това е основната разлика между YAC и M13 Phage Vector. И двете са еднакво полезни в рекомбинантната ДНК технология и генното клониране.

справка:
1. "Вектор". Генетика-бележки - вектор. N.p., n.d. Web. 16 май 2017. https://genetics-notes.wikispaces.com/Vector
2. "Дрождна изкуствена хромозома." Wikipedia. Фондация Wikimedia, 21 април 2017. Мрежата. 16 май 2017 г.. .

С любезност на изображенията:
1. “M13B” от J3D3 - Собствена работа (CC BY-SA 3.0) през Wikimedia на Commons