SDS PAGE срещу гел електрофореза
Електрофорезата може да се използва за определяне на масата на обект обикновено за протеин и дезоксирибонуклеинова киселина (ДНК). Нивото на ДНК, когато се въвежда в химикалите, може да ускори или забави информационния процес. ДНК маркерите с известна маса се използват за приблизително определяне на размера на обектите, пътуващи след приключване на електрофорезата. Електрофорезата най-вероятно е най-използваният инструмент за молекулярни биолози и биохимици.
Има два вида електрофореза, които обикновено се използват в този процес. Това са електрофореза на гел натриев додецил сулфат, полиакриламиден гел (SDS-PAGE) и електрофореза с естествен гел.
SDS-PAGE е неселективен метод за гел електрофореза, използван в области като: биохимия, криминалистика, биология и генетика за отделяне на протеина от тяхната електрофоретична мобилност. SDS е анионно повърхностно активно вещество, което може да се използва за подпомагане на лизирането на клетките по време на екстракцията на ДНК и за разделяне на протеини в SDS-PAGE. По време на електрофорезата смес от протеин първо се втечнява в разтвор на SDS. Тогава вещество, наречено Mercaptoeetanol се прилага за отстраняване на дисулфидни връзки, за да направи протеина линеен. След това се започва електрофореза. Резултатите ще дадат два остатъка от молекули, една от които е SDS-PAGE.
Липсата на SDS-PAGE не е проблем, тъй като гел електрофорезата все още може да се направи само, че протеините не губят цялата си вторична и третична структура и не се отварят в обикновено прави пръчки.
Междувременно родният гел електрофореза използва гела като антиконвективна среда. Обикновено се използва за разделяне на биологични макромолекули като ДНК, рибонуклеинова киселина (РНК) и протеин. Може да се използва и за отделяне на наночастиците.
Има два основни гела, използвани в естествената гел електрофореза, а именно:
Агарозен гел, който се използва за по-големи молекули. Този гел не идентифицира малки разлики между две молекулни ленти. Той се използва единствено и само за отделяне на ДНК. Визуализацията на агарозен гел се извършва със сместа от етидиев бромид.
Полиакриламиден гел, който се използва за по-малки молекули. Този гел идентифицира разликите между молекулните ленти. Освен ДНК, тя също може да отделя протеини.
Резюме:
1.SDS-PAGE е неселективен метод за гел електрофореза, използван в области като: биохимия, криминалистика, биология и генетика за отделяне на протеина от електрофоретичната им мобилност, докато гел електрофорезата обикновено се използва за отделяне на биологични макромолекули като ДНК, рибонуклеинова киселина (РНК) и протеин. Може да се използва и за отделяне на наночастиците.
2.Нафорен гел електрофореза има два вида, а именно: агарозен гел и полиакриламиден гел.