Разлика между Страница на SDS и Native Page

Ключова разлика - Страница на SDS срещу Native страница
 

SDS и естествената страница са два вида техники за електрофореза на полиакриламиден гел, използвани в молекулярната биология. Най- ключова разлика между SDS Page и Native Page е използваният тип полиакриламиден гел. Следователно в SDS Page се използва денатуриращ гел, молекулите се разделят въз основа на молекулното им тегло. За разлика от тях, в Native Page се използват неденатуриращи гелове. Следователно молекулите се разделят въз основа на техния размер, заряд и форма.

Полиакриламидният гел електрофореза (Страница) използва гел, получен чрез полимеризиране на акриламидни мономери с метилен бисакриламид. Полиакриламидът е по-твърд и устойчив на топлина от агарозата. Полиакриламидните гелове имат по-малък размер на порите, което позволява ефективно разделяне на протеини. Има два основни типа настройки за страница, а именно SDS Page и Native Page. Страница на SDS или Електрофореза на гел натриев додецил сулфат полиакриламид гел разделя протеините въз основа на техните молекулни тегла. Денатуриращите гелове се използват в SDS Page. Native Page използва неденатуриращи гелове и отделя протеини въз основа на техния размер, заряд и форма (3D конформация).

СЪДЪРЖАНИЕ

1. Преглед и ключова разлика
2. Какво е страница на SDS
3. Какво е Native Page
4. Прилики между Страница на SDS и Native Page
5. Сравнение рамо до рамо - Страница SDS срещу Native страница в таблична форма
6. Резюме

Какво е страница на SDS?

SDS Page е най-разпространената електрофоретична техника, използвана за разделяне на протеини въз основа на молекулното им тегло. Гелът е направен чрез добавяне на SDS (Натриев додецил сулфат), който е детергент. SDS протезира протеини в мономери. SDS е анионен почистващ препарат. Следователно, той добавя нетен отрицателен заряд към протеините в широк диапазон на рН. Когато нетният отрицателен заряд се предаде на протеиновите молекули, поради вариацията на заряда, сложните структури се разграждат. Поради отрицателния заряд протеините привличат към положителния край. По този начин молекулите с по-ниско молекулно тегло пътуват по-бързо по гел матрицата и могат да се наблюдават близо до анода, докато протеините с по-високо молекулно тегло се наблюдават по-близо до ямките.

Фигура 01: Страница на SDS

Свързването на SDS към полипептидната верига е пропорционално на относителната му молекулна маса. Следователно, молекулната маса може да бъде определена и чрез SDS Page. Оцветяването на SDS Page геловете се извършва чрез оцветяване с бромофенолово синьо. Приложенията на SDS страницата варират в по-голяма степен, където може да се използва за оценка на относителната молекулна маса и за определяне на относителното изобилие на протеини в протеинова смес. SDS Page може да се използва и за определяне на разпределението на протеини в смес от протеини. SDS Page също така се прилага за пречистване и оценка на протеини. Той се използва като предварителна процедура за западно блотиране и хибридизация, която от своя страна се използва за картографиране и идентификация на протеини.

Какво е Native Page?

Електрофорезата на Native Polyacrylamide гел (Native Page) използва неденатуриращ гел. Следователно, SDS или всеки друг денатуриращ агент не се добавя към гелната матрица. В Native Page, разделянето на протеините се основава на заряда и размера на протеина. Следователно, мобилността на протеина зависи от заряда и размера на протеина.

Зареждането на протеина зависи от страничните вериги на аминокиселините. Ако страничните вериги са отрицателно заредени, протеинът ще получи общ отрицателен заряд и обратно. Протеините запазват 3D конформация поради сгъването, което се осъществява. Сгъването се получава от няколко вида връзки в протеини като дисулфидни връзки, хидрофобни взаимодействия и Водородни връзки. Следователно, ако нативната страница се носи при неутрално pH, протеините ще бъдат разделени според молекулната форма на протеина. Следователно, Native Page може да се използва като чувствителна техника за откриване на промяната в заряда или конформацията на протеина.

Основното предимство на собствената страница е, че протеинът, използван за анализа на страницата, може да бъде възстановен в първоначалното си състояние след анализа на страницата, тъй като протеинът не се нарушава по време на процеса. Native Page е сравнително висока пропускателна техника и стабилността на протеина се повишава.

Фигура 02: Родна страница

След завършване на гела, гелът Native Page може да бъде видян чрез оцветяване с бромофенолово синьо или друг подходящ оцветяващ реагент. Приложенията на Native Page включват отделяне на киселинни протеини, включително гликопротеини като човешки рекомбинантен еритропоетин или идентифициране на протеини, присъстващи в говежди серумен албумин (BSA).

Какви са приликите между страницата на SDS и Native Page?

• Както SDS Page, така и Native Page системите използват полиакриламиден гел като матрица на гела.
• И двете се използват за разделяне и идентифициране на протеини.
• И двамата използват електрофоретична мобилност за разделяне на съединенията.
• И двете могат да се извършват вертикално или хоризонтално (най-вече се правят като вертикални настройки на страницата, защото дължината на изпълнение е повече).
• Апаратурата за електрофореза, включваща резервоара за гел, гребените, захранването е необходимо за работата на двете техники.
• Визуализацията на гела може да се извърши чрез оцветяване на методите и в двете техники.

Каква е разликата между страницата на SDS и Native Page?

Страница на SDS срещу Native Page
Страница на SDS или страница натриев додецил сулфат разделя протеините въз основа на молекулното им тегло и той използва денатуриращ гел.	Native Page използва неденатуриращи гелове и отделя протеини въз основа на техния размер, заряд и форма (3D конформация).
Тип гел
В SDS-страница се използва денатуриращ гел.	В основната страница се използва неденатуриращ гел.
Наличие на SDS
SDS присъства като детергент за добавяне на отрицателен заряд върху пробата в страницата на SDS.	SDS не присъства в родната страница.
Основа за отделяне
Разделянето на протеините зависи от молекулното тегло на протеина в страницата на SDS.	Разделянето зависи от размера и формата на протеиновата молекула в естествената страница.
Стабилност на протеина
Стабилността на протеина е ниска при страница на SDS.	Стабилността на протеина е висока в родната страница.
Възстановяване на оригиналния протеин
Не е възможно, тъй като е денатуриран в страницата на SDS.	Възможно е на родната страница.

резюме - Страница на SDS срещу Native страница

SDS Page и Native Page са два вида техники за електрофореза на полиакриламиден гел, използвани за разделяне на протеини. SDS Page се обработва с детергент, наречен SDS. SDS придава общ отрицателен заряд на протеина, което след това води до денатурация на протеина. Следователно протеините се разделят на базата на тяхното молекулно тегло. За разлика от тях, техниката на Native Page не използва никакво денатуриращо средство. По този начин протеините са или разделени въз основа на техния размер или формата. Това е разликата между страницата на SDS и основната страница.

справка:

1. „Принципът и методът на полиакриламидната гел електрофореза (SDS-PAGE).“ Принципът и методът на полиакриламидната гел електрофореза (SDS-PAGE) | MBL Life Sience -ASIA-. Налични тук
2. "Родни гелове." Протеинови лаборатории на Alliance | Услуги за биофизична характеристика. Налични тук  

С любезност на изображенията:

1.'SDS-PAGE Електрофореза 'чрез Bensaccount в английската Wikipedia, (CC BY 3.0) през Commons Wikimedia  
2. 'Заредете проба в електрофореза с полиакриламиден гел' Blaz Nemec от Любляна, Словения (CC BY-SA 2.0) чрез Wikimedia Commons